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禾谷镰刀菌和稻瘟病菌基因组中的微卫星序列比较

文献类型： 中文期刊

作者： 李成云 1 ; 李进斌 2 ; 刘林 1 ; 杨静 1 ; 周晓罡 3 ;

作者机构： 1.农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室

2.云南省农业科学院植物保护研究所

3.云南省农业科学院生物技术研究所

关键词： 禾谷镰刀菌;稻瘟病菌;基因组;微卫星序列;分布

期刊名称： 植物保护学报

ISSN： 0577-7518

年卷期： 2005 年 32 卷 03 期

页码： 251-255

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用禾谷镰刀菌 Fusarium graminearum 和稻瘟病菌 Magnaporthe grisea 基因组测序结果,对这两种植物病原真菌基因组中的微卫星(SSR)序列进行了系统地分析和比较。结果表明,在禾谷镰刀菌基因组中,共发现4679个 SSR 序列,总长度为96.2 kb,占基因组全长的0.27%。平均7.7kb 碱基中有一个大于15 bp 的 SSR 序列。在稻瘟病菌基因组中共发现16398个 SSR 系列,其总长度达到330 kb,约占整个基因全长的0.85%,平均2.36 kb 碱基中就分布有1个 SSR 序列。在禾谷镰刀菌基因组中,数量最多的是五碱基重复序列,其次是六碱基重复序列;稻瘟病菌基因组中数量最多的是单碱基重复序列,其次为三碱基重复序列和五碱基重复序列。两基因组中数量最少的都是二碱基重复序列。尽管这两种植物病原真菌都属子囊菌,基因组大小也十分接近,但无论是在SSR 的总体数量上,还是在各类 SSR 的分布上,两种植物病原真菌都存在十分显著的差别。

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