您好，欢迎访问云南省农业科学院 机构知识库！

禾谷镰刀菌和稻瘟病菌基因组中的微卫星序列比较

文献类型： 中文期刊

作者： 李成云 1 ; 李进斌 2 ; 刘林 1 ; 杨静 1 ; 周晓罡 3 ;

作者机构： 1.农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室

2.云南省农业科学院植物保护研究所

3.云南省农业科学院生物技术研究所

关键词： 禾谷镰刀菌;稻瘟病菌;基因组;微卫星序列;分布

期刊名称： 植物保护学报

ISSN： 0577-7518

年卷期： 2005 年 32 卷 03 期

页码： 251-255

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用禾谷镰刀菌 Fusarium graminearum 和稻瘟病菌 Magnaporthe grisea 基因组测序结果,对这两种植物病原真菌基因组中的微卫星(SSR)序列进行了系统地分析和比较。结果表明,在禾谷镰刀菌基因组中,共发现4679个 SSR 序列,总长度为96.2 kb,占基因组全长的0.27%。平均7.7kb 碱基中有一个大于15 bp 的 SSR 序列。在稻瘟病菌基因组中共发现16398个 SSR 系列,其总长度达到330 kb,约占整个基因全长的0.85%,平均2.36 kb 碱基中就分布有1个 SSR 序列。在禾谷镰刀菌基因组中,数量最多的是五碱基重复序列,其次是六碱基重复序列;稻瘟病菌基因组中数量最多的是单碱基重复序列,其次为三碱基重复序列和五碱基重复序列。两基因组中数量最少的都是二碱基重复序列。尽管这两种植物病原真菌都属子囊菌,基因组大小也十分接近,但无论是在SSR 的总体数量上,还是在各类 SSR 的分布上,两种植物病原真菌都存在十分显著的差别。

  • 相关文献

[1]稻瘟病菌基因组中微卫星序列的频率和分布. 李成云,李进斌,周晓罡,董爱荣,许明辉. 2004

[2]稻瘟病菌阅读框架中SSR频率、分布及所在基因功能. 李成云,李进斌,周晓罡,张绍松,董爱荣,许明辉. 2005

[3]玉米黑粉病菌基因组中的微卫星序列的组成和分布. 李成云,李进斌,周晓罡,张绍松,许明辉. 2005

[4]粗糙脉孢菌基因组中的微卫星序列的组成和分布. 李成云,李进斌,周晓罡,张绍松,许明辉. 2004

[5]非洲菊ESTs-SSR标记的频率和分布特点. 王继华,瞿素萍,唐开学,李成云,陈海如. 2006

[6]稻瘟病菌细菌人工染色体(BAC)基因组文库的构建. 周晓罡,朱立煌,翟文学,李进斌,罗朝喜,李成云. 2002

[7]构巢曲霉菌基因组中的数量可变重复序列的组成和分布. 李成云,李进斌,周晓罡,张绍松,许明辉. 2005

[8]稻瘟病菌二个无毒基因的初步分析. 李进斌,李成云,罗朝喜,尹良芬,周晓罡,陈艳. 2002

[9]稻瘟病菌细菌人工染色体(BAC)基因组文库的构建. 周晓罡,李成云,朱立煌,翟文学,李进斌,罗朝喜. 2002

[10]稻瘟病菌二个无毒基因的初步分析. 李进斌,罗朝喜,尹良芬,李成云,周晓罡,陈艳. 2002

[11]稻瘟病菌八个组合后代菌株对楚粳3号的致病性遗传分析. 李成云,李进斌,周晓罡,陈艳. 2002

[12]稻瘟病菌细菌人工染色体(BAC)基因组文库的构建. 周晓罡,朱立煌,翟文学,李进斌,罗朝喜,李成云. 2002

[13]稻瘟病菌蛋白激酶编码基因中SSR变异及其对蛋白结构的潜在影响. 刘林,李进斌,张悦,苏源,杨静. 2010

[14]稻瘟病菌致病机制及无毒基因的研究进展. 李露,李成云,杨明,万洪辉. 2001

[15]稻瘟病菌色素遗传研究. 罗朝喜,李进斌,李成云. 2000

[16]稻瘟病菌无毒基因的分子标记. 李成云,罗朝喜,李进斌,沈瑛,伊势一男. 2000

[17]云南元阳哈尼梯田稻瘟病菌遗传多样性分析. 林菁菁,李进斌,刘林,李夏,李会芬,何霞红,朱书生,李成云,朱有勇. 2009

[18]氮胁迫条件下稻瘟病菌分泌蛋白致病性分析. 周晓罡,苏源,李成云,丁玉梅,张绍松,孙茂林,李进斌. 2009

[19]稻瘟病菌含信号肽小蛋白的计算机分析. 业艳芬,李成云,杨静,王云月,李进斌,刘林,苏源,朱有勇. 2006

[20]云南省稻瘟病菌无毒基因的地理分布(英文). 李进斌,杨静,刘林,何汉明,何霞红,朱有勇,李成云. 2011

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：云南省农业科学院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台