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基于SSR标记的云南地方稻种群体内遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 孙建昌 1 ; 余滕琼 2 ; 汤翠凤 2 ; 曹桂兰 1 ; 徐福荣 2 ; 韩龙植 1 ;

作者机构： 1.中国农业科学院作物科学研究所/国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程/农业部作物种质资源利用重点开放实验室

2.云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所

关键词： 水稻;地方品种;群体内遗传多样性;微卫星标记

期刊名称： 中国水稻科学

ISSN： 1001-7216

年卷期： 2013 年 27 卷 01 期

页码： 41-48

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 用20对SSR引物对原产于云南的16份地方稻种和2份选育品种进行单个品种群体内的遗传多样性分析。结果表明,87.5%的地方品种群体内SSR多态性高于选育品种,而12.5%的地方品种群体内SSR标记多态性与选育品种相近。81.2%的地方稻种群体内的等位基因数(Na)和Nei基因遗传多样性指数(He)高于选育品种,而18.8%的地方品种群体内Na和He与选育品种相同或略小。水稻地方稻种群体内He的差异较大,其变异范围为0.0146～0.5117,其中,黄板所-1(1980年收集)、黄板所-2(2007年收集)、麻线谷-1(1980年收集)、麻线谷-2(2007年收集)的群体内遗传多样性较高,分别为0.2327、0.4214、0.5117和0.4489。87.5%地方品种的杂合度(Ho)明显高于选育品种;地方品种群体间遗传多样性差异很大,其中1/4的遗传差异来源于地方稻种群体内,差异极显著。RM333、RM257和RM180在供试云南地方稻种群体内的多态性、等位基因数、多样性指数和变异百分率均较高,适用于云南地方稻种群体内遗传多样性检测。

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