您好,欢迎访问云南省农业科学院 机构知识库!

玉米黑粉病菌基因组中的微卫星序列的组成和分布

文献类型: 会议论文

第一作者: 李成云

作者: 李成云 1 ; 李进斌 2 ; 周晓罡 1 ; 张绍松 1 ; 许明辉 1 ;

作者机构: 1.云南省农业科学院生物技术研究所

2.云南省农业科学院植物保护研究所(昆明)

关键词: 玉米黑粉病菌;基因组;微卫星序列;频率;分布;遗传标记

会议名称: 中国植物病理学会2004年学术年会

主办单位: 中国植物病理学会

页码: 18-25

摘要: 本文利用已经分布的玉米黑粉病菌基因组测序结果,对该真菌基因组中基序为1-6碱基的微卫星(SSR)序列进行了系统地分析.结果表明,在已经分布的19.7Mb的基因组序列中,共有6607个SSR系列(长度大于15bp,匹配值大于80%);其碱基总数为149363bp,占整个基因组缄基数的0.76%,平均3.0kb碱基中就分布有一个大于15bp的SSR序列.其中数量最多为六碱基重复序列,总长度达55806bp,其次为三碱其重复,数量达到38679bp,五碱基重复序列(2545bp).数量最少的是单碱基重复序列,只有6551bp.

分类号: S435.131.41

  • 相关文献

[1]粗糙脉孢菌基因组中的微卫星序列的组成和分布. 李成云,李进斌,周晓罡,张绍松,许明辉. 2004

[2]稻瘟病菌基因组中微卫星序列的频率和分布. 李成云,李进斌,周晓罡,董爱荣,许明辉. 2004

[3]非洲菊ESTs-SSR标记的频率和分布特点. 王继华,瞿素萍,唐开学,李成云,陈海如. 2006

[4]稻瘟病菌阅读框架中SSR频率、分布及所在基因功能. 李成云,李进斌,周晓罡,张绍松,董爱荣,许明辉. 2005

[5]禾谷镰刀菌和稻瘟病菌基因组中的微卫星序列比较. 李成云,李进斌,刘林,杨静,周晓罡. 2005

[6]构巢曲霉菌基因组中的数量可变重复序列的组成和分布. 李成云,李进斌,周晓罡,张绍松,许明辉. 2005

[7]灰盖鬼伞基因组中微卫星序列的组成. 刘林,李成云,杨静,业艳芬,李进斌,周晓罡,王云月,朱有勇. 2006

[8]云南省稻瘟病菌无毒基因的地理分布(英文). 李进斌,杨静,刘林,何汉明,何霞红,朱有勇,李成云. 2011

[9]拟南芥图位克隆快速初定位系统的建立. 阚东阳,柯学,Walid Ghidan,肖素勤,肖卿,胡向阳,孔祥祥,黄兴奇,程在全. 2018

[10]蜜蜂功能基因研究进展. 李淑琼,丁建,余林生. 2007

[11]基于生物信息学的睡莲SSR位点特征分析. 苏群,田敏,刘俊,王凌云,李春牛,李先民,黄展文,王虹妍. 2021

[12]药用昆虫基因组研究现状与进展. 罗惠,刘莹,汤沈杨,贺康,李飞. 2023

[13]稻瘟菌基因组规模分泌蛋白的预测分析. 苏源,李成云,赵之伟,周晓罡,李进斌,杨静,刘林,业艳芬. 2006

[14]悬钩子属植物分子标记技术和基因组研究进展. 杨燕林,唐开学,和加卫,朱映安,和志娇,杨正松. 2008

[15]稻瘟病菌细菌人工染色体(BAC)基因组文库的构建. 周晓罡,朱立煌,翟文学,李进斌,罗朝喜,李成云. 2002

[16]西方蜜蜂Sirtuin蛋白家族基因鉴定及表达分析. 宋文菲,刘娜,苗春辉,余玉生,胡宗文,王艳辉,李亚辉. 2023

[17]甘蔗属种及其近缘属种蔗茅的全基因组密码子偏好性分析. 田春艳,李旭娟,李纯佳,毛钧,刘新龙. 2024

[18]家蚕种质资源的研究及展望. 刘敏,吴克军. 2009

[19]一种侵染鳢肠的双生病毒基因组特征. 钟静,赵丽玲,尹跃艳,李婷婷,丁铭,李凡. 2017

[20]云南大叶茶遗传标记研究进展. 季鹏章,云南省农业生物技术重点实验室,张俊. 2007

作者其他论文 更多>>