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常绿杜鹃种质遗传多样性分析及SSR指纹图谱构建

园艺学报 2025 北大核心 CSCD

摘要:利用马缨杜鹃(Rhododendron delavayi Franch.)基因组测序数据进行genomic-SSR的分布特征分析和多态性SSR引物开发,并对61份常绿杜鹃种质进行亲缘关系分析和指纹图谱构建,以实现种质间亲缘关系聚类及其亲本来源推测。开发出了15对多态性高、稳定性好、亚属间通用性强的SSR引物,在61份种质中共检测到等位基因位点126个,每对引物的平均等位基因数(Na)为8.400,平均有效等位基因数(Ne)为3.4681,平均观测杂合度(H_o)和期望杂合度(He)分别为0.3421和0.5347,平均多态信息含量(PIC)为0.6338。群体遗传结构分析结果将61份常绿杜鹃种质分成3个亚类群,与亲缘关系聚类结果基本一致,结合已知谱系资料推测所引进日本品种的祖先亲本来源于两个不同的分布地,且包括自育品种在内的所有品种均是以常绿杜鹃亚属(subgen.Hymenanthes)常绿杜鹃组(sect.Ponticum)内物种为亲本的杂交种。利用5个SSR标记成功构建出61份常绿杜鹃种质的指纹图谱。

关键词: 常绿杜鹃 基因组SSR标记 遗传多样性 指纹图谱

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胡椒枯萎病植株与健康植株根际土壤细菌群落结构差异性分析

中国热带农业 2025

摘要:胡椒是我国重要的热带经济作物,而枯萎病是其主要病害之一。为了深入探究云南省绿春县枯萎病频发的原因,分析根际土壤细菌群落结构及其与土壤环境因子的关联,并揭示健康与发病状态下的胡椒根际土壤细菌群落及环境因子的差异,采集健康和患枯萎病的胡椒植株根际土壤样本,通过16s扩增子测序技术和生物信息学方法,分析健康与患病样品间细菌群落多样性和组成变化,以及土壤环境因子与细菌群落的关联性。结果表明,患病植株根际土壤细菌群落的丰富度和多样性高于健康植株:在门水平上,患病植株根际土壤中放线菌门的相对丰度显著高于健康植株,但绿弯菌门和酸杆菌门的相对丰度与之相反;在属水平上,健康根际土壤中的嗜酸栖热菌属、HSB_OF53-F07、酸杆菌属、JG30a-KF-32、FCPS473相对丰度显著高于患病植株,患病的土微菌属、卢得曼氏菌属、鞘氨醇单胞属的相对丰度显著高于健康植株。LEfSe算法分析结果显示,健康与患病胡椒根际土壤所富集细菌差别较大;RDA分析表明,铵态氮、有机碳和脲酶活性是影响健康与患病胡椒根际细菌群落组成的关键因子。根际土壤细菌群落结构和环境因子与胡椒健康状态紧密相关,推测绿弯菌门和酸杆菌门等有益细菌门相对丰度显著减少和土壤酶活性的降低是导致枯萎病发生的关键因素,可为制定科学有效的防控策略提供理论基础。

关键词: 枯萎病 胡椒 根际细菌 土壤理化性质 多样性

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三角梅主要品种表型性状分析

热带作物学报 2025 北大核心 CSCD

摘要:三角梅是我国南方重要的木本花卉,品种繁多,但分类比较混乱。本研究以云南引种保存的133个三角梅品种为研究对象,对133个品种的10个数量性状和41个质量性状进行频率分布统计、变异系数计算和多样性指数计算,并进行Q型聚类分析。结果表明:133个三角梅品种多个性状多样性丰富,数量性状的变异系数范围为19.61%~32.59%,平均值为26.64%,花序总梗长度、花被管宽度、叶柄长度、花序长度的变异系数最高,多样性指数范围为1.69~2.09,平均值为1.92,叶片长度、苞片宽度、叶片宽度、苞片长度的多样性指数最高。质量性状多样性指数为0.17~2.19,多样性指数大于1的质量性状有11个,苞片颜色、花被管颜色多样性指数均大于2,多样性丰富。4个种系的三角梅品种中,巴特三角梅数量性状的多样性指数最高,多样性最丰富,其次是秘鲁三角梅、光叶三角梅,毛叶三角梅的多样性指数最小,多样性较小,但不同种系各有优势性状。51个性状中,有22个性状在种系之间呈现出了显著差异性,此22个性状对三角梅品种识别和类群划分具有重要的参考价值。根据苞片类型、枝刺多少、叶片大小进行聚类,133个三角梅品种可聚为重瓣少刺、重瓣多刺、单瓣少刺小叶、单瓣多刺大叶4类。上述研究结果显示,供试133个三角梅品种的表型性状多样性较高,数量性状变异类型丰富,本研究可为三角梅种质资源的系统评价、品种分类和种质创新提供参考。

关键词: 三角梅 变异系数 多样性 分类指标

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嗜根考克氏菌与植物乳植杆菌复合发酵对香肠品质及细菌群落的影响

肉类研究 2025

摘要:以嗜根考克氏菌(Kocuria rhizophila)AP1和植物乳植杆菌(Lactiplantibacillus plantarum)L复配接种发酵香肠,以自然发酵香肠为空白对照,通过测定发酵香肠的pH值、水分含量、水分活度、亚硝酸盐含量、质构特性、色差、游离氨基酸含量及活菌数等指标,探究嗜根考克氏菌AP1和植物乳植杆菌L复合发酵对香肠品质的影响。结果表明:接种发酵剂后,pH值、亚硝酸盐含量显著降低(P<0.05),具有较高的安全性;提高了香肠的硬度和咀嚼性、提升了亮度和色泽,促进了发酵香肠游离氨基酸的释放,提升了香肠的感官品质;接种处理增强了优势菌的竞争力,抑制了有害菌的生长,嗜根考克氏菌AP1与多数游离氨基酸产量呈正相关。因此,考克氏菌与乳酸菌复配发酵可提升香肠品质和安全性。

关键词: 嗜根考克氏菌 植物乳植杆菌 发酵香肠 细菌多样性 游离氨基酸 理化特性 感官品质

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保山市代表性古茶树资源表型与生化组分多样性研究

2025

摘要:云南省保山市地处世界茶树发源中心地带,古茶树资源极为丰富,是普洱茶和滇红茶核心产区,研究该地区古茶树资源表型和生化组分多样性,对优异茶树种质资源挖掘利用、整合与保护,以及核心种质构建和优良新品种选育具有重要意义。本研究测定了保山市73份代表性古茶树资源的形态学和生化组分共50个性状,利用变异系数、遗传多样性指数、相关性分析、主成分分析和聚类分析等方法,系统评价了古茶树资源多样性。结果显示,23个质量性状多样性指数在4.135~4.277之间,平均为4.234;27个数量性状多样性指数在3.545~4.287之间,平均为4.187,变异系数介于7.88%~153.13%之间,大部分性状表现出极为丰富的遗传变异。27个数量性状相关性分析表明,部分性状间呈显著或极显著相关。主成分分析结果显示,前6个主成分累积贡献率为68.419%,其中,生化组分、叶片性状和茶树花性状是茶树变异的主要因素。通过对不同区域间有差异的21个数量性状分析表明,不同区域古茶树资源在叶片性状、茶树花性状和生化组分含量间存在一定差异。根据27个数量性状将73份古茶树资源分为5类,其中第 Ⅰ类、第Ⅱ类和第Ⅳ类属适制绿茶类型资源,第Ⅲ类和第Ⅴ类属红绿茶兼制型资源,从73份古茶树资源中筛选出特异资源36份,其中高茶多酚(≥25%)资源6份、高氨基酸(≥5%)资源29份、低咖啡碱(≤1.5%)资源1份。本研究为保山市古茶树资源有效开发利用研究提供了基础性种质资源信息和科学依据。

关键词: 保山市 古茶树资源 多样性

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基于SSR分子标记分析农家保护与种质库保存对云南地方稻种等位变异的影响

2025

摘要:目的基于SSR分子标记分析农家保护与种质库保存下云南地方稻种等位变异,以期分析农家保护与种质库保存方式对水稻种质资源多样性的影响,为地方稻种遗传多样性的有效保护及其保护途径选择提供理论依据。方法以种质库保存的12份地方稻种(命名为品种名-1)与其对应农家保护的地方稻种(命名为品种名-2)为试验材料,利用72个SSR分子标记对这24份地方稻种材料(共12组)进行遗传多样性及等位变异分析。结果供试24份地方稻材料共检测出等位基因数490个,变幅4~12个,平均6.8个,Nei’s基因多样性指数0.337~0.910,平均为0.769。农家保护的地方稻种较种质库保存的地方稻种等位基因数量、特有等位基因数量、有效等位基因数量均略低,但Nei’s基因多样性指数略高,表明农家保护的地方稻种遗传多样性略有降低。农家保护的小白糯-2和烂地谷-2分别在标记RM333和RM213上未检测出等位变异位点,小白糯-2、老粳糯-2和老鼠牙-2分别在标记RM349、RM18和RM333上检测出纯合等位变异位点,表明农家保护下部分等位位点流失。12组地方稻种材料间的遗传相似性系数为0.222~0.917,其中香谷的遗传相似性系数最高,小白糯的最低,在遗传相似系数为0.205处可将供试地方稻种材料聚类为籼、粳两大类,每组对应地方稻种材料均对应聚在一小类,表明供试对应地方稻种具有较高的遗传相似性且对应程度较高。24份地方稻种材料共检测出等位变异位点数260个,变幅6~57个,其中28个位点与抗逆相关,25个与育性相关,33个与抗病虫相关,26个与产量及营养相关,且农家保护下理论产量提高,表明农家保护下产生遗传变异可能是向着提高适应性来增加产量的方向发展。结论在农家保护下地方稻种的部分等位基因纯合与流失是其遗传多样性降低的内在原因,而其在育性、抗病虫、抗逆、产量及营养高效等功能连锁标记上产生大量的遗传变异,并呈株高降低、产量增加的变化趋势,增强了地方稻种应对自然生态环境和社会环境压力变化的能力,说明农家保护是地方稻种资源多样性保护的有效途径之一。

关键词: 地方稻种 SSR标记 等位变异 农家保护 遗传多样性

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救荒野豌豆种质资源调查收集及表型鉴定评价

2025

摘要:救荒野豌豆(Vicia sativaL.)是豆科野豌豆属一年生或二年生高蛋白冷季豆类,具有耐寒、耐旱、耐瘠薄的特性,被广泛用作绿肥和饲料,在作物轮作系统中发挥了重要作用。过去,我国对救荒野豌豆种质资源缺乏系统的调查收集和鉴定评价,为了进一步探索其利用价值,选育高产优异种质,本研究在贵州、青海、四川和云南地区采集了212份救荒野豌豆种质资源,进行田间试验,调查表型数据进行多样性分析和鉴定评价。结果表明,救荒野豌豆种质资源的16个农艺性状遗传多样性丰富,其中单株粒数变异系数最高,为70%;根据相关性分析,大部分性状之间呈极显著正相关;对来自不同地区的救荒野豌豆进行性状差异统计分析得出,贵州与四川地区的种质只在成熟期性状上差异极显著,青海、云南地区的种质与其他地区的种质在大部分性状上差异显著或极显著;主成分分析将16个农艺性状集中在累计贡献率达到81.1%的5个主成分,其中第1主成分主要与单株粒重、单株粒数、干荚长和单株荚数等产量性状相关,而第2主成分主要与粒长、百粒重和粒宽等籽粒大小相关;通过主成分三维聚类图分析发现,不同地区的种质在表型上存在明显分化,云南和青海的种质单独聚类成簇,而贵州和四川的种质聚在一起,说明川黔两地的资源在形态性状上较为相似。通过进一步的表型鉴定评价,筛选出两份救荒野豌豆多荚多粒种质,单株荚数均大于100个,单株粒数均大于800粒。同时还筛选到了2份大粒种质,其中1份具有早熟特征。以上结果为救荒野豌豆种质资源的保护利用和育种改良提供了宝贵资源和理论支撑。

关键词: 救荒野豌豆 种质资源 调查收集 表型鉴定 遗传多样性

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林下野生滇黄精生长对土壤细菌群落多样性的影响

中国野生植物资源 2025 CSCD

摘要:目的:深入了解林下滇黄精生长对森林土壤理化性质以及土壤微生物群落结构和功能的影响.方法:采用高通量测序技术对3年生健康林下滇黄精根际和非根际土壤细菌群落多样性进行研究.结果:与非根际样本相比,根际样本中的细菌群落丰富度(Ace、Chao1)明显较低,两个样本间细菌群落结构存在显著差异(R2=0.936,P=0.006).在根际样本中,有55种细菌属显著上调,主要是以酸杆菌门为主,如Gp6、Gp4等,下调的微生物有51种,主要是Devosia和Ohtaekwangia等.同时发现土壤中有机碳、pH和有效氮对样本群落差异有显著影响,是促进根际酸杆菌亚群显著富集的主要驱动力.此外,根际样本中的细菌群落网络结构较为单一,而非根际样本中的网络结构则更加复杂.基于FAPROTAX数据库,共对51种细菌基因功能进行了注释,根际样本中反硝化作用(如亚硝酸盐反硝化、硝酸盐反硝化等)和自养(如光合自养等)类相关的功能基因显著高于非根际,而与硝化作用相关的基因却极少.结论:滇黄精生长对森林土壤细菌群落具有显著调控作用,它改变了林下土壤细菌群落的结构和相关网络模式,研究结果不仅有助于理解林下滇黄精生长与根际微生物互作机制,也为其他药用植物林下种植技术研究提供新思路.

关键词: 滇黄精 林下栽培 群落多样性 根际细菌群落

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60个香石竹品种花部表型多样性分析

扬州大学学报(农业与生命科学版) 2025 北大核心 CSCD

摘要:香石竹是世界上最重要的花卉之一,其花色丰富,花形优雅,鲜切花保鲜期持久.为分析香石竹在花部性状上的遗传多样性,依据现有国家标准(GB/T 19557.23-2018)对60个香石竹品种花部11个数量性状、20个质量/假质量性状进行多样性、相关性和主成分分析,对品种进行聚类和观赏性综合评价.结果表明:11个数量性状的种内变异系数为3.42%~10.87%,品种间变异系数为12.74%~42.19%,数量性状多样性指数为1.020~1.666,质量/假质量性状多样性指数为0.085~2.079,遗传多样性较为丰富;在465对性状组合中,共有36对性状具显著相关性,数量性状间相关性系数(0.844)较高;9个主成分累积贡献率为80.083%,在构建的香石竹观赏性评价模型中,植株类型、花朵数为最关键影响因子;聚类分析将60个品种分为4类,分别为单色类群、复色且花萼花青甙均不显色类群、花瓣边缘缺刻类型为圆齿和锯齿的大花类群、花萼花青甙显色且色调为偏红色的大花类群.这一研究结果可丰富香石竹表型数据库,为其品种鉴定和选育提供参考.

关键词: 香石竹 花部 遗传多样性 主成分分析 聚类分析

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根际土壤真菌对旱种水稻生长及稻瘟病抗性的影响

西南农业学报 2025 北大核心 CSCD

摘要:[目的]研究陆稻和水稻旱种时的根际土壤真菌的多样性及功能.[方法]单孢分离根际土壤真菌,PCR扩增真菌ITS序列,选取分离出的透孢黑团壳菌、茎点霉、瓶头霉、卵形孢球托霉、绿僵菌、犁头霉、拟青霉菌7个根际土壤真菌接种陆稻和水稻旱种幼苗,统计种子萌发率,并测量株高.同时选用水稻品种丽江新团黑谷(LTH),先接种透孢黑团壳菌和茎点霉2个根际土壤真菌,再接种稻瘟病菌GUY11,测量叶片病斑长度,Real-time PCR检测MoPot2基因表达,并观察水稻抗病性.[结果]鉴定到71株根际土壤真菌,含17属54种,其中,镰刀菌、青霉菌和紫色紫孢霉是水稻和陆稻根际土壤中的优势菌群.根际土壤真菌多样性在各陆稻和水稻品种中依次为日本晴>大丫口谷>月亮谷>老寨黑谷>冷泉谷>香塘谷.透孢黑团壳菌、茎点霉、瓶头霉、卵形孢球托霉、绿僵菌、犁头霉、拟青霉菌7个根际土壤真菌均促进水稻品种月亮谷、日本晴、LTH及陆稻品种香塘谷、老寨黑谷和冷泉谷的生长,抑制陆稻品种大丫口谷的生长;透孢黑团壳菌处理促进LTH对稻瘟病的抗性,而茎点霉处理减弱了 LTH对稻瘟病的抗性.透孢黑团壳菌和茎点霉处理诱导水稻品种LTH中水杨酸受体基因OsNPR1及植保素中樱花素合成基因OsNOMT的表达.[结论]水稻旱种时的根际土壤真菌多样性通过调控植株生长及抗病性促进水稻适应旱种环境.

关键词: 水稻 陆稻 旱地种植 根际土壤 真菌 多样性

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