科研产出
滇黑两省黄瓜花叶病毒南瓜分离物外壳蛋白基因序列分析
《园艺学报 》 2006 北大核心 CSCD
摘要：利用免疫捕捉多聚酶链式反应(Immuno-Capture PCR,IC-PCR)方法从南瓜的两个黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)云南分离物(CMV-YN)和黑龙江分离物(CMV-HLJ)中扩增获得约700bp的外壳蛋白(Coat protein,CP)基因片段,并克隆到pGEM-T载体中。核苷酸序列测定表明,CMV-HLJ和CMV-YN两个分离物CP基因长为657bp,编码219个氨基酸,两个分离物的核苷酸和氨基酸同源性分别达到96.8%和97.4%。和国外CMV亚组Ⅰ6个分离物核苷酸序列同源性在90%以上,氨基酸同源性在97%以上,和亚组Ⅱ6个分离物的同源性分别为66.4%和73.4%。和国内亚组Ⅰ10个分离物的核苷酸同源性都在89.5%以上,氨基酸同源性在93%以上,而和亚组Ⅱ两个分离物的同源性分别为68.3%和73.5%。序列分析结果表明CMV-HLJ和CMV-YN两个分离物属于CMV亚组Ⅰ。
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西瓜花叶病毒2号南瓜分离物的鉴定及其外壳蛋白基因序列分析
《植物病理学报 》 2004 北大核心 CSCD
摘要：利用电镜和酶联免疫吸附测定法(ELISA)在黑龙江省采集的南瓜病样中检测到西瓜花叶病毒2号(WMV-2)。再利用免疫PCR(IC-PCR)和反转录PCR(RT-PCR)方法,扩增获得其外壳蛋白(CP)基因片段,并克隆到pGEM-T载体中。核苷酸序列测定表明,该分离物CP基因全长为852个核苷酸,编码由284个氨基酸组成的31.8 kDa蛋白。与国外已报道的WMV-2 CP基因相比,其核苷酸序列同源性为92.2％-94.O％,由此推导的氨基酸序列同源性为94.5％-98.1％。与国内2个分离物相比,和山西分离物核苷酸和氨基酸的同源性都达到98.5％,和郑州分离物核苷酸和氨基酸的同源性分别为91.5％和95.0％。
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