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微卫星标记分析水稻地方品种30年的遗传变异

文献类型: 中文期刊

作者: 严红梅 1 ; 董超 2 ; 张恩来 2 ; 汤翠凤 2 ; 阿新祥 2 ; 杨文毅 2 ; 杨雅云 2 ; 张斐斐 2 ; 徐福荣 2 ;

作者机构: 1.云南省农业科学院质量标准与检测技术研究所

2.云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所

关键词: 元阳哈尼梯田;SSR标记;遗传多样性;等位基因位点;水稻

期刊名称: 遗传

ISSN: 0253-9772

年卷期: 2012 年 34 卷 01 期

页码: 89-96

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为揭示水稻(Oryza sativa)地方品种30年的遗传变异状况,文章通过60个SSR标记,对元阳哈尼梯田农户在20世纪70年代种植的6个(简称"过去的品种")和近10年间种植的对应6个(简称"当前的品种")代表性水稻地方品种进行检测。结果表明,共检测到159个等位基因(Na),等位基因数1~4不等,当前的品种较过去的品种减少7个等位基因。平均每个标记检测到的等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、基因型多样性(H′)和位点多态信息含量(PIC)4个指标均为过去的品种高于当前的品种,分别是(Na)为2.567>2.450,(Ne)为2.052>1.968,(H′)为0.768>0.722,(PIC)为0.469>0.439。基于60个SSR标记,过去6个品种间的遗传相似性系数(GS)平均值为0.437,变幅为0.117~0.667,而当前6个品种间平均值为0.473,变幅为0.200~0.700。总的说来,水稻地方品种经过30年自然和人工选择,遗传多样性降低,不同品种存在等位基因大小的差异程度不同。

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