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长雄野生稻(Oryza longistaminata)全基因组Fosmid文库构建

文献类型: 中文期刊

作者: 李丽娟 1 ; 蔡晶 2 ; 张石来 3 ; 王荔 1 ; 胡凤益 3 ;

作者机构: 1.云南农业大学

2.中国科学院昆明动物研究所

3.云南省农业科学院粮食作物研究所

关键词: 长雄野生稻;Fosmid文库;末端测序

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2012 年 10 卷 04 期

页码: 86-90

收录情况: CSCD

摘要: 长雄野生稻(O.longistaminata)起源于非洲,具有和亚洲栽培稻相同的AA基因组,是栽培稻改良的重要遗传资源。本研究构建了长雄野生稻全基因组fosmid文库,共获得33.6万克隆,文库的平均插入片段大小约为40kb,其中94.7%的克隆插入片段大小在30~50kb之间。挑取其中约11万克隆并保存,可覆盖10倍栽培稻基因组,对任意基因或序列的筛选概率达到了99.99%。将剩余的22万个克隆进行了末端配对测序,显示其有助于长雄野生稻全基因组测序的拼接。所构建的fosmid文库为筛选和克隆长雄野生稻的有利基因提供了研究材料。

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