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一种改良的水稻细胞质基因组制备方法

文献类型： 中文期刊

作者： 万雯婷 1 ; 董扬 1 ; 于洋 1 ; 李丽娟 1 ; 张静 1 ;

作者机构： 1.云南农业大学农学院中国科学院昆明动物所云南省农业科学院粮食作物研究所

关键词： 水稻;叶绿体DNA;线粒体DNA

期刊名称： 云南农业大学学报(自然科学版)

ISSN： 1004-390X

年卷期： 2011 年 04 期

页码： 437-443

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 水稻叶绿体和线粒体基因组较小,且均被测序清楚,可以作为研究细胞质遗传的良好材料,而如何快速有效地分离纯化获得高产量和高质量的细胞质基因组是从DNA水平上研究细胞质遗传变异的前提条件。本研究结合了蔗糖密度梯度离心法-全基因组DNA扩增法(whole genome amplification,WGA),对细胞质基因组的制备进行了改良。改良后的方法仅使用20 g的水稻叶片,即可在2 d时间内得到浓度达300 ng/μL以上,总量达40μg以上的高纯度(OD260/280值为1.8～2.0)、完整的叶绿体DNA(chloroplast DNA,cpDNA)和线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)。该法制备的细胞质基因组可以满足多种细胞质基因组实验的要求,包括Solexa全基因组测序技术的要求。

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