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苦荞FtHCT的基因克隆与生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 杨晓琳 1 ; 段迎 1 ; 蔡苏云 1 ; 贺润丽 1 ; 尹桂芳 2 ; 王艳青 2 ; 卢文洁 2 ; 孙道旺 2 ; 王莉花 2 ;

作者机构: 1.山西中医药大学中药与食品工程学院

2.云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室农业农村部西南作物基因资源与种质创制重点实验室

关键词: 苦荞;HCT;基因克隆;生物信息学;表达分析

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2023 年 001 期

页码: 102-109

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究克隆木质素生物合成途径关键酶莽草酸/奎宁酸羟基肉桂酰转移酶(HCT),探究苦荞HCT基因的表达调控以及对苦荞果壳发育形成的影响。运用RT-PCR技术克隆获得两条苦荞HCT基因,命名为Ft HCT-1、FtHCT-2,对两基因编码蛋白进行生物信息学分析,对不同组织器官及果壳不同时期混合材料进行RT-qPCR表达分析。结果表明:FtHCT-1、FtHCT-2开放阅读框序列长度分别为1 347、1 278 bp,各编码448和425个氨基酸,蛋白分子量分别为49.66和46.57 kD,理论等电点为5.72和6.64,均为亲水性蛋白,处在细胞质内,均属于PLNO2481和Trasferase超家族,具有高度同源。两基因表达存在明显差异。本研究克隆所得两条HCT基因在苦荞果壳生长发育中特定表达,推断其表达影响苦荞果壳木质素合成,为薄果壳形成的关键基因。

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