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紫娟茶树miR828a靶基因WER的克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘悦 1 ; 曲浩 1 ; 尚卫琼 1 ; 孙云南 1 ; 田易萍 1 ; 仝佳音 1 ; 陈林波 1 ;

作者机构： 1.云南省农业科学院茶叶研究所云南省茶学重点实验室

关键词： 茶树;miR828a;WER;RACE方法;克隆;生物信息学分析

期刊名称： 山西农业科学

ISSN：

年卷期： 2020 年 011 期

页码： 1707-1710,1723

摘要： 为进一步了解mi R828a靶基因WER的功能及生物学特性,通过RACE方法对紫娟茶树WER基因进行克隆,并使用生物信息学Protparam、Signal P、SWISS-Mo DEL等工具对其序列进行分析.结果表明,WER基因全长885 bp,含有一条276 bp的完整开放阅读框,编码92个氨基酸,与番樱桃So MYB114具有较高的亲缘性;WER属于不稳定亲水蛋白,具有跨膜结构域,亚细胞定位于质膜和线粒体上,推测WER蛋白在质膜和线粒体上发挥信号转导的作用.

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