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蒜芥茄SsVe1和SsVe2基因的克隆及表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 吴丽艳 1 ; 尹梦莹 1 ; 念润 1 ; 黎志彬 1 ; 鲍锐 1 ; 董相书 2 ; 龚亚菊 1 ; 杜光辉 2 ;

作者机构: 1.云南省农业科学院园艺作物研究所国家蔬菜改良中心云南分中心

2.云南大学农学院

关键词: 蒜芥茄;Ve基因克隆;生物信息学;表达分析

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2021 年 023 期

页码: 7680-7687

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 黄萎病是危害茄子生产的主要病害之一,对黄萎病抗性基因研究是解决该病危害严重的有效途径。本研究以黄萎病抗性材料野生蒜芥茄(Solanum sisymbriifolium)为研究对象,在前期转录组测序的基础上,通过RT-qPCR技术克隆得到2个Ve同源基因的c DNA全长,分别命名为SsVe1和SsVe2。其中,SsVe1 cDNA序列有3 615 bp,含3 168 bp开放阅读框,编码1 061个氨基酸;SsVe2 cDNA序列有3 756 bp,含3 456 bp开放阅读框,编码1 157个氨基酸。2个Ve基因所编码的氨基酸具有极高的相似性,均富含抗病基因共有的结构域—亮氨酸重复序列(LRR),可编码R蛋白;亚细胞定位预测基因产物均在细胞壁上;此外,2个基因编码蛋白的二级、三级结构预测结果也高度相似,以上结果预示着SsVe1和SsVe2功能的相似性。与已报道的其它植物Ve基因对比分析结果表明:SsVe1和SsVe2基因与野生茄S. torvum中Ve基因的关系较近。实时荧光定量PCR检测结果表明:蒜芥茄接种大丽轮枝菌(Verticillium dahliae)后,SsVe1和SsVe2均表现出先下调(0~12 h)后上调(12~48 h)的趋势;同时,Ve基因在蒜芥茄不同组织中的表达有一定的差异,SsVe2基因的表达量高于SsVe1,且两者在根、茎部的表达量高于叶片。本研究结果为探究Ve基因在茄子黄萎病抗性分子机制中的作用和功能奠定了基础。

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