文献类型： 中文期刊

作者： 俎峰 ¹ ; 李霞 ¹ ; 何晓莹 ¹ ; 张国建 ¹ ; 张建昆 ¹ ; 董云松 ¹ ; 王敬乔 ¹ ; 束正齐 ¹ ; 陈苇 ¹ ;

作者机构： 1.云南省农业科学院经济作物研究所;云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所;云南省农业职业技术学院

关键词： 油菜;基因克隆;大籽粒;比较测序;EOD3基因

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2019 年 01 期

页码： 20-24

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】克隆拟南芥籽粒大小发育母体效应基因EOD3在甘蓝型油菜籽粒中表达的同源基因拷贝,并在大、小籽粒材料间开展序列比较分析。【方法】以1份大籽粒与1份小籽粒种质发育中的籽粒为研究材料,利用RT-PCR克隆发育中籽粒表达的BnEOD3基因拷贝,结合生物信息学手段在大、小籽粒材料间进行差异比较分析。【结果】生物信息学分析发现BnEOD3基因在甘蓝型油菜中有4个同源拷贝(BnaC04g00760D,BnaA05g01200D,BnaC04g50960D,BnaA04g27100D)。其中BnaA04g27100D在大、小籽粒材料发育籽粒中均有表达,且在第114碱基处存在SNP变异(大籽粒为C,小籽粒为G),BnaC04g50960D则仅在小籽粒材料中检测到表达,BnaC04g00760D与BnaA05g01200D基因则在大、小籽粒中均未检测到表达。【结论】BnEOD3基因仅有2个拷贝(BnaA04g27100D和BnaC04g50960D)在发育籽粒中检测到表达,其中BnaA04g27100D在第114碱基处的SNP变异导致氨基酸序列甘氨酸(G)与丙氨酸(A)的氨基酸的差异,可能与大、小籽粒性状有关。