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元江普通野生稻金属硫蛋白(YJMT-2)的获得及序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 史冬燕 1 ;

作者机构： 1.山东菏泽学院生命科学系

关键词： 元江普通野生稻;金属硫蛋白;cDNA;序列分析

期刊名称： 四川农业大学学报

ISSN： 1000-2650

年卷期： 2009 年 27 卷 01 期

页码： 42-46

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对SMARTTM技术构建的元江普通野生稻叶片cDNA文库克隆进行随机测序,获得了元江普通野生稻金属硫蛋白(YJMT-2)的cDNA序列。该序列全长为558 bp,5′-端非翻译区为84 bp,3′-端非翻译区为247 bp,开放阅读框长度为225 bp(包括一个终止密码子),可编码74个氨基酸,蛋白分子量为7.51 kD,理论等电点(PI)为6.51,其中含12个半胱氨酸(Cys),占了总氨基酸的16.22%,且集中分布在肽链的N端和C端,呈CXC排列方式,具有植物MT-2的典型特征;经Pfam15.0分析证明,其属于金属硫蛋白家族的成员。BlastP同源性分析,该基因与日本粳稻、大麦的同源性较高,分别为98%和65%。首次得到元江普通野生稻金属硫蛋白基因,为其功能研究提供了基础。

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