文献类型: 中文期刊
作者: 朱兴正 1 ; 夏丽飞 2 ; 陈林波 2 ; 田易萍 2 ; 宋维希 2 ; 蒋会兵 3 ;
作者机构: 1.云南省农业科学院茶叶研究所/云南省茶树种质资源创新与配套栽培技术工程研究中心;云南省茶学重点实验室
2.;云南省农业科学院茶叶研究所/云南省茶树种质资源创新与配套栽培技术工程研究中心;云南省茶学重点实验室
3.;云南省农业科学院茶叶研究所/云南省茶树种质资源创新与配套栽培技术工程研究中心;云南省茶学重点实验室;
关键词: 云茶1号;全长转录组;基因分析;功能注释
期刊名称: 茶叶科学
ISSN: 1000-369X
年卷期: 2018 年 02 期
页码: 193-201
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为探讨云茶1号茶树品种优异性状的遗传基础,采用Pac Bio平台进行全长转录组测序,最终获得Polished consensus序列213 389个,预测到CDS有223 120个,检测到195 062个SSR位点。在NR数据库有170 264个同源序列比对到980个物种;有103 124个在KOG数据库得到注释,根据其功能各分为26类;有65 524个得到GO注释分为细胞组分、分子功能及生物学过程等三大类的55个功能组;根据KEGG数据库,105 972个得到了注释,涉及到216个代谢途径分支,包括茶叶品质、活性物质代谢以及抗逆等相关基因等;还预测到隶属于60个转录因子家族的转录因子有5 785个。这些结果为进一步开展云茶1号茶树特异性状基因的标记性引物开发、遗传研究以及品质形成和抗逆机制研究奠定了基础。
- 相关文献
[1]基于PacBio平台的紫娟茶树全长转录组分析. 夏丽飞,孙云南,宋维希,朱兴正,田易萍,蒋会兵,陈林波. 2020
[2]“紫娟”茶外观表象差异研究. 蔡丽,梁名志,夏丽飞,陈林波,孙云南. 2010
[3]优质、抗病大叶茶新品种“云茶1号”选育. 张俊,田易萍,徐丕忠,张惠. 2008
[4]云南省部分稻种资源稻瘟病抗性评价及基因分析. 王群,杨佩文,杨勤忠,郑凤萍,李家瑞. 2001
[5]137份云南省地方稻抗白叶枯病多菌系多基因鉴定. 李玉琢,陈玲,张敦宇,管娟,张云,钟巧芳,殷富有,李馨,杨顺发,王波,程在全,罗琼,肖素勤. 2023
[6]云南离褶伞属资源遗传多样性的RAPD分析. 李林玉,李荣春,金航,张金渝,李绍平. 2005
作者其他论文 更多>>
-
云南茶树种质资源研究60年
作者:宁功伟;杨盛美;宋维希;李友勇;唐一春;赵红艳;刘本英
关键词:云南;茶树种质资源;进展;展望
-
叉角厉蝽对于不同虫龄茶谷蛾幼虫的捕食功能反应
作者:龚雪娜;罗梓文;玉香甩;曲浩;王雪松;龙丽雪;张东;梁晓静;陈林波;龙亚芹
关键词:叉角厉蝽;茶谷蛾;捕食行为;功能反应
-
137份茶树人工杂交F1代单株表型性状及遗传多样性分析
作者:邓少春;田易萍;陈林波;陈春林;庞丹丹;徐丕忠;包云秀;朱兴正
关键词:茶树;F1代;人工杂交;芽叶;表型性状;遗传多样性
-
云抗10号加工普洱茶工艺优化
作者:杨方慧;仝佳音;张艳梅;孙云南;汤海昆;夏丽飞
关键词:云抗10号;普洱茶;加工工艺;内含成分
-
苦茶碱代谢关键转录因子基因的筛选鉴定
作者:刘玉飞;庞丹丹;李友勇;蒋会兵;田易萍;孙云南;陈林波
关键词:苦茶;苦茶碱;RNA测序;转录因子
-
云南省茶园茶谷蛾的发生及其习性观察
作者:龙亚芹;任国敏;王雪松;罗梓文;龙丽雪;李金龙;曲浩;李晓霞;玉香甩;李云娜;汪云刚;陈林波
关键词:茶谷蛾;为害状;形态特征;生物学特性
-
不同季节紫娟白茶香气组分探究
作者:许燕;孙云南;玉香甩;田易萍;浦绍柳
关键词:紫娟白茶(Camellia assamica var. Zijuan);香气组分;不同季节