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保护品种云茶1号茶树全长转录组测序分析

文献类型： 中文期刊

作者： 朱兴正 1 ; 夏丽飞 2 ; 陈林波 2 ; 田易萍 2 ; 宋维希 2 ; 蒋会兵 3 ;

作者机构： 1.云南省农业科学院茶叶研究所/云南省茶树种质资源创新与配套栽培技术工程研究中心;云南省茶学重点实验室

2.;云南省农业科学院茶叶研究所/云南省茶树种质资源创新与配套栽培技术工程研究中心;云南省茶学重点实验室

3.;云南省农业科学院茶叶研究所/云南省茶树种质资源创新与配套栽培技术工程研究中心;云南省茶学重点实验室;

关键词： 云茶1号;全长转录组;基因分析;功能注释

期刊名称： 茶叶科学

ISSN： 1000-369X

年卷期： 2018 年 02 期

页码： 193-201

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探讨云茶1号茶树品种优异性状的遗传基础,采用Pac Bio平台进行全长转录组测序,最终获得Polished consensus序列213 389个,预测到CDS有223 120个,检测到195 062个SSR位点。在NR数据库有170 264个同源序列比对到980个物种;有103 124个在KOG数据库得到注释,根据其功能各分为26类;有65 524个得到GO注释分为细胞组分、分子功能及生物学过程等三大类的55个功能组;根据KEGG数据库,105 972个得到了注释,涉及到216个代谢途径分支,包括茶叶品质、活性物质代谢以及抗逆等相关基因等;还预测到隶属于60个转录因子家族的转录因子有5 785个。这些结果为进一步开展云茶1号茶树特异性状基因的标记性引物开发、遗传研究以及品质形成和抗逆机制研究奠定了基础。

  • 相关文献

[1]基于PacBio平台的紫娟茶树全长转录组分析. 夏丽飞,孙云南,宋维希,朱兴正,田易萍,蒋会兵,陈林波. 2020

[2]优质、抗病大叶茶新品种“云茶1号”选育. 张俊,田易萍,徐丕忠,张惠. 2008

[3]“紫娟”茶外观表象差异研究. 蔡丽,梁名志,夏丽飞,陈林波,孙云南. 2010

[4]云南省部分稻种资源稻瘟病抗性评价及基因分析. 王群,杨佩文,杨勤忠,郑凤萍,李家瑞. 2001

[5]137份云南省地方稻抗白叶枯病多菌系多基因鉴定. 李玉琢,陈玲,张敦宇,管娟,张云,钟巧芳,殷富有,李馨,杨顺发,王波,程在全,罗琼,肖素勤. 2023

[6]云南离褶伞属资源遗传多样性的RAPD分析. 李林玉,李荣春,金航,张金渝,李绍平. 2005

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