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基于RNA-Seq的雌蕊缺失茶树花转录组分析

文献类型： 中文期刊

作者： 夏丽飞 1 ; 陈林波 1 ; 李梅 2 ; 宋维希 1 ; 田易萍 1 ;

作者机构： 1.云南省农业科学院茶叶研究所

2.云南省农业科学院茶叶研究所云南省茶树种质资源创新与配套栽培技术工程研究中心安徽农业大学茶树生物学与资源利用国家重点实验室

关键词： 茶树;雌蕊缺失;转录组;RNA-seq;基因注释

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2017 年 03 期

页码： 858-866

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 茶树是重要的叶用经济作物,但是茶树每年都要开花结实,消耗大量的养分,导致茶树鲜叶产量减少和品质降低。雌蕊缺失茶树资源是天然的不结实茶树品种。采用Illumina Hi Seq TM 2 500高通量测序技术,对雌蕊缺失茶树花花芽、花蕾、花进行转录组分析。经组装获得237 484条Transcripts,取最长Transcripts作为Unigene,有182 123条,将获得的Unigene与Nr、Nt、Pfam、KOG/COG、Swiss-prot、KEGG、GO等七种数据库进行注释,有22 049条Unigene被注释上26种KOG分类,注释到KEGG的Unigene条数为21 315,涉及的pathway有130条。此外,发掘出与花器官形态建成的ABCDE模型的功能基因31个,这些注释信息的完成为茶树花器官发育基因及性别决定相关基因的发掘提供了重要依据。

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