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基于紫娟茶叶片转录组的SSR引物开发

文献类型: 中文期刊

作者: 周萌 1 ; 宋维希 1 ; 鄢文光 1 ; 李晓霞 1 ; 陈继伟 1 ; 夏丽飞 1 ; 梁家斌 1 ; 陈林波 1 ;

作者机构: 1.云南省农业科学院茶叶研究所;云南省茶树种质资源创新与配套栽培技术工程研究中心

关键词: 紫娟茶;SSR;引物开发

期刊名称: 华北农学报

ISSN: 1000-7091

年卷期: 2016 年 31 卷 S1 期

页码: 140-145

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以稀有茶树品种紫娟茶为研究对象,进行SSR引物开发的研究,从紫娟茶叶片转录组中筛选重复基元最多的SSR,设计并筛选紫娟茶的SSR引物。通过从已测序的紫娟茶叶片转录组中设计SSR引物共87对,通过对紫娟茶以及随机采摘的3份不同品种茶树提取DNA后进行PCR扩增,1%琼脂糖凝胶电泳分析,在紫外凝胶成像仪中观察拍照,判断是否扩增出目标条带。通过试验筛选出可以扩增出清晰目标条带的引物63对,有效率达72.4%,其中有33对表现出多态性,占有效SSR引物的52.4%。结果表明,从紫娟茶叶片转录组中设计引物是可行的。下一步研究将从这63对引物中开发紫娟茶的特异引物。

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