科研产出
常绿杜鹃种质遗传多样性分析及SSR指纹图谱构建
《园艺学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：利用马缨杜鹃（Rhododendron delavayi Franch.）基因组测序数据进行genomic-SSR的分布特征分析和多态性SSR引物开发，并对61份常绿杜鹃种质进行亲缘关系分析和指纹图谱构建，以实现种质间亲缘关系聚类及其亲本来源推测。开发出了15对多态性高、稳定性好、亚属间通用性强的SSR引物，在61份种质中共检测到等位基因位点126个，每对引物的平均等位基因数（Na）为8.400，平均有效等位基因数（Ne）为3.4681，平均观测杂合度（H_o）和期望杂合度（He）分别为0.3421和0.5347，平均多态信息含量（PIC）为0.6338。群体遗传结构分析结果将61份常绿杜鹃种质分成3个亚类群，与亲缘关系聚类结果基本一致，结合已知谱系资料推测所引进日本品种的祖先亲本来源于两个不同的分布地，且包括自育品种在内的所有品种均是以常绿杜鹃亚属（subgen.Hymenanthes）常绿杜鹃组（sect.Ponticum）内物种为亲本的杂交种。利用5个SSR标记成功构建出61份常绿杜鹃种质的指纹图谱。
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基于SSR分子标记分析农家保护与种质库保存对云南地方稻种等位变异的影响
2025
摘要：目的基于SSR分子标记分析农家保护与种质库保存下云南地方稻种等位变异，以期分析农家保护与种质库保存方式对水稻种质资源多样性的影响，为地方稻种遗传多样性的有效保护及其保护途径选择提供理论依据。方法以种质库保存的12份地方稻种（命名为品种名-1）与其对应农家保护的地方稻种（命名为品种名-2）为试验材料，利用72个SSR分子标记对这24份地方稻种材料（共12组）进行遗传多样性及等位变异分析。结果供试24份地方稻材料共检测出等位基因数490个，变幅4~12个，平均6.8个，Nei’s基因多样性指数0.337~0.910，平均为0.769。农家保护的地方稻种较种质库保存的地方稻种等位基因数量、特有等位基因数量、有效等位基因数量均略低，但Nei’s基因多样性指数略高，表明农家保护的地方稻种遗传多样性略有降低。农家保护的小白糯-2和烂地谷-2分别在标记RM333和RM213上未检测出等位变异位点，小白糯-2、老粳糯-2和老鼠牙-2分别在标记RM349、RM18和RM333上检测出纯合等位变异位点，表明农家保护下部分等位位点流失。12组地方稻种材料间的遗传相似性系数为0.222~0.917，其中香谷的遗传相似性系数最高，小白糯的最低，在遗传相似系数为0.205处可将供试地方稻种材料聚类为籼、粳两大类，每组对应地方稻种材料均对应聚在一小类，表明供试对应地方稻种具有较高的遗传相似性且对应程度较高。24份地方稻种材料共检测出等位变异位点数260个，变幅6~57个，其中28个位点与抗逆相关，25个与育性相关，33个与抗病虫相关，26个与产量及营养相关，且农家保护下理论产量提高，表明农家保护下产生遗传变异可能是向着提高适应性来增加产量的方向发展。结论在农家保护下地方稻种的部分等位基因纯合与流失是其遗传多样性降低的内在原因，而其在育性、抗病虫、抗逆、产量及营养高效等功能连锁标记上产生大量的遗传变异，并呈株高降低、产量增加的变化趋势，增强了地方稻种应对自然生态环境和社会环境压力变化的能力，说明农家保护是地方稻种资源多样性保护的有效途径之一。
关键词： 地方稻种 SSR标记 等位变异 农家保护 遗传多样性
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救荒野豌豆种质资源调查收集及表型鉴定评价
2025
摘要：救荒野豌豆（
关键词： 救荒野豌豆 种质资源 调查收集 表型鉴定 遗传多样性
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60个香石竹品种花部表型多样性分析
《扬州大学学报(农业与生命科学版) 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：香石竹是世界上最重要的花卉之一,其花色丰富,花形优雅,鲜切花保鲜期持久.为分析香石竹在花部性状上的遗传多样性,依据现有国家标准(GB/T 19557.23-2018)对60个香石竹品种花部11个数量性状、20个质量/假质量性状进行多样性、相关性和主成分分析,对品种进行聚类和观赏性综合评价.结果表明:11个数量性状的种内变异系数为3.42%~10.87%,品种间变异系数为12.74%~42.19%,数量性状多样性指数为1.020~1.666,质量/假质量性状多样性指数为0.085~2.079,遗传多样性较为丰富;在465对性状组合中,共有36对性状具显著相关性,数量性状间相关性系数(0.844)较高;9个主成分累积贡献率为80.083%,在构建的香石竹观赏性评价模型中,植株类型、花朵数为最关键影响因子;聚类分析将60个品种分为4类,分别为单色类群、复色且花萼花青甙均不显色类群、花瓣边缘缺刻类型为圆齿和锯齿的大花类群、花萼花青甙显色且色调为偏红色的大花类群.这一研究结果可丰富香石竹表型数据库,为其品种鉴定和选育提供参考.
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30份木薯种质资源表型性状遗传多样性分析及综合评价
《植物遗传资源学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：以30份木薯种质资源为研究对象，测定40个表型性状，综合运用多样性指数、相关性分析和主成分分析等方法对木薯种质表型性状进行遗传多样性分析及系统评估，并筛选优异的木薯种质资源。结果表明，24个质量性状遗传多样性指数在0.393～2.056，广义遗传力在91.16%～100%，其中遗传多样性指数最高的是嫩茎颜色，最低的是烂根情况，且遗传多样性指数大于1的性状有第一片完全展开叶的颜色、顶端未展开嫩叶颜色、块根形状等12个性状；16个数量性状的变异系数在12.17%～61.66%，遗传多样性指数在0.7614～2.0883，广义遗传力在84.19%～99.58%，其中遗传多样性指数最高的是收获指数，最低的是叶片裂叶数，除叶片裂叶数外，株高、鲜薯淀粉含量、叶面积等15个性状的遗传多样性指数均大于1，说明30份木薯类型多样、遗传多样性丰富。株高与单株块根鲜重、成熟主茎内皮颜色、块根肉质颜色等呈一定的相关性。主成分分析提取到13个主成分，累计贡献率达到了82.23%，其中株高、茎粗、顶端未展开嫩叶颜色、单株块根鲜重等21个性状贡献较大。逐步回归分析法确定了顶端未展开嫩叶颜色、块根分布等7个性状对木薯综合性状影响显著。利用隶属函数综合评价法筛选出H588、GR6、GR3等排名前10的优异种质资源。聚类分析将30份种质分为4大类，第Ⅰ类为高产、高淀粉类群；第Ⅱ类为株高中等、结薯集中、收获指数较高、开花多的杂交育种材料类群；第Ⅲ类为株型直立、高产类群；第Ⅳ类为分枝低、植株偏小、淀粉含量适中的低位分枝类群。研究结果可为木薯种质资源高效发掘利用和新品种选育提供参考。
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云南烟草产区辣椒脉斑驳病毒的调查及其遗传多样性分析
《植物保护 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：明确辣椒脉斑驳病毒(chilli veinal mottle virus,ChiVMV)在云南6个州(市)烟草生产区的分布、遗传多样性和群体遗传结构,对病害的防控预警具有重要意义.本研究以2022年采集自云南6个州(市)不同烟草产区的96份疑似感染ChiVMV的烟草样品为试验材料,利用电子显微镜负染色观察和分子生物学方法对病毒进行检测和鉴定,获得21个ChiVMV云南烟草分离物的 cp基因序列.利用SDT、MEGA、RDP、DnaSP及Arlequin等生物学软件对21个云南烟草分离物及NCBI上下载的38个来自不同国家、地区及寄主的ChiVMV分离物cp基因序列的系统进化、遗传多样性和群体遗传结构特征进行分析.结果显示,从云南6个州(市)烟草生产区采集的96份烟草样品中,ChiVMV检出率为51.04%;序列比对发现,本研究获得的cp基因与NCBI中38个ChiVMV分离物cp基因的核苷酸一致性在84.1%以上;系统发育分析发现,59个ChiVMV分离物按照地理位置的远近被划分为4个分支,聚类结果具有明显的地理分布特征,而与寄主植物无关;遗传多样性和遗传分化分析表明,4个地理种群的ChiVMV cp基因遗传多样性水平均较高,中国种群与印度、泰国和其他国家种群间发生了很大的遗传分化且差异显著(P<0.05);遗传力分析显示,基因交流、遗传漂变和基因的负选择压力是ChiVMV分离物适应性进化的重要方式.
关键词： 辣椒脉斑驳病毒 云南 遗传多样性 遗传结构 cp基因
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云南蚕区家蚕微孢子虫遗传多样性分析
《生物技术进展 》 2024
摘要：家蚕微孢子虫（Nosema bombycis）是蚕业生产上一种重要病害——微粒子病的病原体。探讨家蚕微孢子虫种内的遗传多样性，可为云南蚕区家蚕微粒子病的防控提供参考依据。从云南省不同养蚕地区收集了感染微孢子虫的病蚕样品，分离纯化家蚕微孢子虫并提取基因组，克隆SSU rDNA(small subunit ribosomal DNA)和ITS(internal transcribed spacer)序列并进行生物信息学分析。结果发现，云南蚕区Nosema bombycis分离株SSU rDNA序列同源性高达99%以上，遗传距离小于0.006，它们在长度和多个位点存在差异，呈现不同程度的多态性；ITS遗传差异较为显著，序列中存在多碱基的插入或缺失、单碱基的转换和颠换。基于SSU rDNA和rDNA-ITS序列构建系统发生树，结果显示，云南蚕区家蚕微孢子虫分离株系间存在遗传分化，种群间亲缘关系与地理位置无直接联系。研究结果丰富了云南蚕区家蚕微孢子虫的种内遗传多样性。
关键词： 家蚕微孢子虫 遗传多样性 核糖体小亚基 转录间隔区
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云南紫色种皮稻种资源的遗传多样性及其色素含量分析
《江苏农业科学 》 2024 北大核心
摘要：云南紫米资源丰富多样，收集来自云南省11个地州40多个县和地区的紫色稻米资源材料141份，对其农艺性状及紫色种皮中的总黄酮、花青素含量等进行测定，并对来自不同地州的紫米资源的遗传多样性进行分析，以及种皮的色素含量与遗传多样性的相关性进行了研究。结果表明，在县(市)分析单元内云南紫色米地方稻种资源的遗传多样性丰富。利用分布于水稻11条染色体上的40对SSR引物检测出151个等位基因，平均每对引物2.425个，每个标记的基因型多样性指数(H′)平均值为1.946 9,变幅为1.411 9～3.106 9,筛选出4个评价云南地方紫色米资源的理想SSR标记。云南地方不同品种的紫米种皮中总酚、类黄酮含量的离散程度较低；云南地方紫米种皮中总酚、类黄酮、花青素含量之间的相关性达极显著水平，表明它们关系较紧密；但花色素的含量与总酚、类黄酮、花色素含量相关性不显著；云南地方紫米种皮中总酚、类黄酮、花青素和花色素含量与苯丙氨酸酶的活性相关性不显著；而各色素成分的含量与酪氨酸酶活性具有一定的负相关性；总酚、类黄酮、花青素含量与多酚氧化酶的活性达显著或极显著相关，但花色素含量与多酚氧化酶的活性呈负相关。综上所述，本研究对云南紫色种皮稻种资源主要农艺性状、遗传多样性以及色素含量进行分析和评价，将有利于初步探索云南优异紫色种皮的形成机制，为紫色水稻种质资源的利用与创新提供优异的种质。
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云南野生猕猴桃资源不同居群遗传多样性及遗传演化关系
《中国南方果树 》 2024 北大核心
摘要：应用SSR分子标记研究云南10个地理居群野生猕猴桃的遗传多样性及遗传演化关系.结果表明,不同地理居群间的遗传多样性水平差异不大;居群间的遗传一致度在0.989 9~0.999 1之间,遗传分化系数(Gst)在0.001 1~0.174 3之间.威信居群与彝良居群间的遗传一致度最高,遗传距离最小,亲缘关系最近;永善居群与云龙居群间的遗传一致度最低,遗传距离最大,亲缘关系最远.10个居群可分为两大类群,师宗、绥江、西畴和永善4个居群聚为类群Ⅰ,麻栗坡、屏边、云龙、镇雄、彝良和威信6个居群聚为类群Ⅱ.类群Ⅰ内的遗传演化关系可分为2个进化层次,师宗居群与绥江居群之间以及西畴居群与永善居群之间的遗传进化关系最近.类群Ⅱ内的遗传演化关系可分为5个进化层次,麻栗坡居群与屏边居群之间的遗传进化关系最近,云龙居群与威信居群之间的亲缘关系较远.研究结果可为加快云南猕猴桃属种质资源的研究利用提供参考.
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利用SSR标记分析普通野生稻遗传多样性
《广东农业科学 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】揭示中国云南景洪、云南元江、江西东乡、缅甸普通野生稻(Oryza rufipogen Griff.)遗传多样性，以及云南景洪和元江普通野生稻原、异位保存下变异情况。【方法】利用36对SSR标记对来自云南景洪异位保护与原位保护区、云南元江异位保护与原位保护区、江西东乡及缅甸共102份普通野生稻进行检测，开展不同地理来源及不同保存方式下普通野生稻居群遗传多样性比较与聚类分析。【结果】供试普通野生稻检测出等位变异(Na)110个，平均3.056个，变幅为1～5个；Nei's基因多样性指数(I)平均为0.448。不同地理来源Nei’s基因多样性指数大小为：缅甸(0.561)>云南景洪(0.437)>云南元江(0.236)>江西东乡(0.230)，云南景洪和元江的普通野生稻Nei’s基因多样性指数均表现为异位保护区大于原位保护区(云南景洪：0.498>0.131，云南元江：0.264>0.035)。聚类与遗传分化分析显示，供试材料平均遗传相似系数为0.772，变幅0.260～1.000；在遗传相似系数0.635处可将供试材料划分为云南景洪、云南元江、江西东乡及缅甸居群。云南景洪原位保护区与缅甸的普通野生稻遗传距离较近(0.560)，云南元江原位保护区与江西东乡的普通野生稻遗传距离较近(0.552)；而云南元江原位保护区与景洪原位保护区的普通野生稻遗传距离为0.748，表明云南元江和景洪普通野生稻有明显的遗传分化。【结论】不同地区的普通野生稻遗传分化有明显的地域性，云南景洪和元江普通野生稻遗传多样性因原生境居群减少而下降。
关键词： 普通野生稻 SSR标记 遗传多样性 居群 原位保护 异位保护 遗传分化
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