科研产出
稻瘟菌基因组规模分泌蛋白的预测分析
《云南农业大学学报 》 2006 CSCD
摘要:利用信号肽分析软件S ignalP v3.0,亚细胞器蛋白定位软件TargetP v1.01,GPI-锚定位点软件b ig-PIPred ictor和跨膜螺旋结构软件THMM-2.0这4个软件分析预测稻瘟菌12 595个蛋白序列中有1 134个分泌蛋白。编码这些蛋白的可读框(ORF)最小值为78 bp,最大值为7 849 bp,平均1 231 bp。引导它们的信号肽长度介于15~45个氨基酸之间,平均为21个氨基酸。435个分泌蛋白具有功能描述,主要是与代谢有关的酶类。分析了其中降解细胞壁组分和与致病相关的酶类,提示在稻瘟菌侵染水稻不同阶段产生的关键酶及基因的功能需进一步研究。
云南栽培稻生态型矿质元素含量的多样性(英文)
《作物学报 》 2006 北大核心 CSCD
摘要:用ICP-AES方法测定了新平县相同生态条件下种植的653份云南稻资源糙米8种矿质元素含量,并按丁颖的栽培稻生态型对其遗传多样性进行了研究。结果表明,云南水稻改良品种糙米P、Fe和Zn含量比地方稻种分别下降10.53%1、4.76%和35.16%,但改良品种特别是粳稻Ca含量比地方种高,8种矿质元素以Ca的多样性指数最大;糙米P、Ca、Mg、Fe、Zu、Cu和Mn平均含量以粳稻的Mg、Fe和Zn,水稻的P、K和Mg,陆稻的Fe和Zn,糯稻的K和Fe,早稻的Mg和Fe相对较高。8种矿质元素平均遗传多样性指数依次为粳>籼,陆>水,粘>糯,早中稻>晚稻和地方种>改良种,且P>K>Mn>Mg>Cu>Zn>Fe>Ca;其变异系数依次为Fe>Ca>Cu>Zn>Mn>K>Mg>P。
浅议元谋社会主义新农村建设
《西南农业学报 》 2006 CSCD
摘要:建设社会主义新农村是一项长期而艰巨的任务.坚持从实际出发,因地制宜,分类指导,搞好规划;尊重农民意愿;发扬自力更生,艰苦奋斗精神,求真务实,真抓实干,尽快使广大农村面貌有比较明显的变化.
灰盖鬼伞基因组中微卫星序列的组成
《西南农业学报 》 2006 CSCD
摘要:本研究利用已公布的灰盖鬼伞基因组测序结果,对该真菌基因组中的微卫星(microsatellite)或简单重复序列(simplesequence repeats,SSRs)进行了系统分析。结果表明,在已公布的36.2 Mb的基因组序列中,共有7 859个SSR序列(长度大于15bp,匹配值大于80%)。SSR的碱基总数达143 kb,约占整个基因组碱基数的0.40%,平均4.61 kb中就有1个大于15 bp的SSR序列。其中数量最多的是3碱基SSR,数量达到3 033个,其次为6碱基重复序列(2 121个)、5碱基重复序列(1 820个),这3种SSR总数达6 974个,占SSR总数的84.9%,单碱基重复序列数量最少,仅有285个。与子囊菌中的稻瘟病菌和粗糙脉孢菌相比,灰盖鬼伞菌基因组中每百万碱基中的SSR数量和密度都较小。这些研究结果可为该担子菌基因组的特征描述、注释及分子标记的筛选提供基础信息。
关键词: 微卫星或简单重复序列 频率 分布 分子标记
云南普通野生稻遗传多样性和亲缘关系
《植物学通报 》 2006 北大核心 CSCD
摘要:野生稻(Oryzarufipogon)是稻属的重要组成部分,具有许多优良性状,是水稻遗传改良的天然基因库。本研究通过对形态学性状的观测,及ISSR和RAPDUPGMA聚类分析,将云南普通野生稻划分为4个类型,即元江类型、景洪紫杆直立型、景洪绿杆直立型和景洪匍匐型。在供试材料中筛选到具有多态性的ISSR和RAPD引物各11个,ISSR引物扩增出多态带113条,多态性条带比率(PPB)为82.26%,RAPD引物共扩增出多态性条带76条,PPB值为76.77%,两种分子标记的分析结果呈极显著正相关(r=0.951)。此外UPGMA聚类结果表明,云南普通野生稻不同类型与其它地区普通野生稻之间的遗传亲缘关系差异明显。
关键词: 普通野生稻 亚种 遗传多态性 形态学 RAPD ISSR
光温敏核不育系水稻的光温特性研究
《西南农业学报 》 2006 CSCD
摘要:在人为控制光长条件下,在云南省水富县海拔300 M、700 M 2个试点,对38份水稻光温敏核不育材料的光温反应特性进行观察.结果表明:14份不育系材料属于弱-中-弱类型;5份不育系材料属于弱-长-弱类型;11份不育系材料属于中-中-弱类型;1份材料属于中-中-中类型;7份不育系材料属于强-短-中类型.