文献类型: 中文期刊
作者: 卢珍红 1 ; 莫锡君 1 ; 蒋亚莲 1 ; 余蓉培 1 ; 周旭红 1 ; 田敏 1 ; 杨晓 2 ; 桂敏 1 ;
作者机构: 1.云南省农业科学院花卉研究所
2.云南丰岛花卉有限公司
关键词: 菊花;突变体;无参转录组测序;差异基因
期刊名称: 西南林业大学学报(自然科学)
ISSN: 2095-1914
年卷期: 2017 年 37 卷 02 期
页码: 60-68
收录情况: 北大核心
摘要: 以菊花‘霞光飞跃’叶色突变体和正常植株为试验材料,对其叶绿素含量进行测定,并进行无参转录组测序分析。结果表明:突变体与正常植株相比,叶绿素含量有较大幅度的下降,仅为正常植株的18%左右,叶绿素a/b比值(Chl a/b)显著升高。利用转录组测序技术分别从突变体与正常植株叶片中获得4.75 Gb和4.96 Gb有效数据(Clean Data),de novo组装后得到105 456条通用基因(Unigenes),其中长度大于1 kb的有15 493条,N50为1 556 bp。对Unigenes表达分析,共获得3 762条差异表达基因(DEGs)。对得到的DEGs进行生物学功能性注释,获得总注释信息为2 741。通过对注释信息进行GO和KEGG富集分析,结合定量PCR验证表明,菊花‘霞光飞跃’叶色突变体形成的原因可能是dm GLK2低水平表达和dm GLK1不表达导致叶绿体合成和分裂受阻,叶片细胞内叶绿体数量大大降低,进而叶绿素含量下降。
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