科研产出
'波邦'咖啡叶绿体基因组密码子使用特征研究
《种子 》 2024 北大核心 CSCD
摘要:本研究对小粒咖啡‘波邦’叶绿体基因组进行系统分析,探讨影响密码子使用偏性形成的因素。结果表明,‘波邦’叶绿体基因组密码子偏好性较弱,倾向于A/T结尾的密码子。ENC-GC3s绘图、PR2绘图以及中性绘图分析表明,‘波邦’密码子偏好性受突变影响的同时,也受自然选择等因素的影响,但自然选择起到更大的作用。进一步对应分析发现,基因表达水平、基因长度、GC含量对‘波邦’密码子偏性也有影响。密码子使用频率结果表明,拟南芥、烟草和酿酒酵母可考虑作为‘波邦’基因的表达受体系统,其中,烟草与酿酒酵母更为理想。研究表明,在‘波邦’中发现了GCT、TGT、GAT等20个高频密码子,确定了GCA、GCT、TGT等21个最优密码子。
关键词: ‘波邦’ 小粒咖啡 叶绿体基因组 密码子偏好性 表达效率
咖啡绿蚧对小粒咖啡果实的影响
《中国热带农业 》 2024
摘要:为明确咖啡绿蚧对小粒咖啡果实的影响,通过对果实的13个表型性状进行测定,分析有无咖啡绿蚧危害对咖啡果实的影响.结果表明,咖啡绿蚧危害显著降低了浆果重、浆果纵径、浆果横径、种子纵径、种形指数、果皮重、种子数,显著提高了果实硬度.咖啡大多数果实性状间存在相关性,咖啡绿蚧危害对果实间性状相关性产生了影响,有无咖啡绿蚧危害的果实共同相关性状有4对,差异相关性状分别为4对和6对.主成分分析显示,13个表型性状可归纳为2个主成分,分别为种子数量因子和硬度因子,最终确定种子数和硬度2个指标可作为咖啡绿蚧影响小粒咖啡果实的关键性指标.
关键词: 咖啡绿蚧 小粒咖啡 果实品质 相关性分析 主成分分析
小粒咖啡铁皮卡叶绿体基因组密码子偏好性分析
《西北林学院学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要:为了解铁皮卡叶绿体基因组密码子的使用特征及其成因,以筛选的52条蛋白编码序列为研究对象,利用CodonW和CUSP在线软件对其密码子使用特征进行系统分析。结果表明,基因组各位置的GC含量GC1、GC2、GC3分别为47.47%、39.52%、27.92%,30个高频密码子中,以U结尾占比53.33%,以A结尾占比43.33%,以G结尾占比3.33%,说明铁皮卡叶绿体基因偏好使用NNA和NNU型密码子,尤其偏好使用NNU型密码子。有效密码子数(ENC)、密码子适应指数(CAI)、最优密码子频率(Fop)分别为46.85、0.167、0.352,均揭示该基因组的密码子偏性较弱。中性绘图、ENC-plot、PR2-plot以及对应分析揭示密码子的偏好性受到选择及其他因素共同作用,最终确定了AUU、GUU和UCU等20个最优密码子。表明铁皮卡叶绿体基因组密码子的偏性较弱,偏好AU结尾的密码子。密码子的使用偏好性受到突变及选择等多种作用共同影响。
关键词: 小粒咖啡 铁皮卡 叶绿体基因组 密码子偏好性 最优密码子
保山小粒咖啡园杂草种类及危害现状
《杂草学报 》 2023
摘要:杂草是制约咖啡生长和产量稳定的关键因子,系统性了解咖啡园杂草种类及危害现状,对小粒咖啡园杂草的科学防控具有积极作用。2019—2022年对保山小粒咖啡产区杂草种类及危害进行系统调查,共发现杂草37科86属97种,其中,外来杂草15种,危害较为严重的杂草有白羊草(Bothriochloa ischaemum)、鬼针草(Bidens pilosa)、藿香蓟(Ageratum conyzoides)、小蓬草(Erigeron canadensis)、紫茎泽兰(Ageratina adenophora)、香附子(Cyperus rotundus)、反枝苋(Amaranthus retroflexus)及饭包草(Commelina benghalensis)。建议采用人工、物理、机械及生态除草的方法进行杂草综合防控,禁止使用化学除草。
云南小粒咖啡害虫及其天敌种类
《中国植保导刊 》 2023 北大核心
摘要:2019-2022年在云南省普洱、大理(宾川县)、保山、德宏、临沧、怒江州6个咖啡主产区开展小粒咖啡害虫及其天敌种类和发生程度的系统调查,共发现害虫10目63科109种,其中57种为国内为害小粒咖啡新记录种,为害较为严重的主要害虫有咖啡盔蜡蚧(Saissetia coffeae)、堆蜡粉蚧(Nipaecoccus vastalor)、南洋臀纹粉蚧(Planococcus lilacinus)、白蛾蜡蝉(Lawana imitata)、咖啡绿 蚧(Coccus viridis)、茶茸毒蛾(Dasychira baibarana)、咖啡豹蠹蛾(Zeuzera coffeae)、灭字脊虎天牛(Xylotrechus quadripes)、铜绿丽金龟(Anomala corpulenta)、青脊竹蝗(Ceracris nigricornis)和革衣云南蝗(Yunnanites coriacea)共计11种;发现天敌昆虫8目22科48种,小红瓢虫(Rodolia Pumila)、七星瓢虫(Coccinella septempunctata)、绒茧蜂(A panteles sp.)、黄猄蚁(Oecophylla smaragdina)4 种为优势天敌种类.
云南省3个咖啡产区小粒咖啡病虫害危害调查分析
《热带农业科学 》 2020
摘要:为明确云南省3个咖啡产区小粒咖啡病虫害的种类及危害.对保山市、大理州及临沧市3个咖啡产区13个不同种植模式、海拔高度、区域位置及栽培品种的咖啡生产基地小粒咖啡病虫害的种类及危害进行调查分析.结果表明:云南省3个咖啡产区有小粒咖啡病害5种,虫害26种.其中,保山市小粒咖啡病害3种,虫害19种;大理州小粒咖啡病害3种,虫害10种;临沧市小粒咖啡病害4种,虫害16种.首次发现日本龟蜡蚧(Ceroplastes japonicas)和红蜘蛛(Tetranychidae sp)在云南咖啡产区发生和危害.危害严重和普遍的病虫害有叶锈病、炭疽病、烟煤病、美洲斑潜蝇(Liriomyza sativae)、茶蓑蛾(Clania minuscula)、咖啡绿蚧(Coccus viridis)等12种.种植模式、海拔高度、区域位置及栽培品种对小粒咖啡的病虫害危害有影响.
云南干热河谷区7个小粒咖啡叶片光合特性日变化的研究
《江西农业学报 》 2020
摘要:以云南干热河谷区的7个小粒咖啡品种为试验材料,利用LCpro-SD全自动便携式光合测定仪对其叶片的净光合速率、蒸腾速率、胞间CO2浓度、气孔导度、水分利用效率等光合参数进行了测定.结果表明:大部分咖啡品种的净光合速率的日变化呈不对称的双峰曲线,有明显的光合"午休"现象,但'紫叶'呈单峰曲线变化;7个品种的最大净光合速率表现为紫叶>埃塞俄比亚2号>T5175>矮卡(航天)>矮卡>埃塞俄比亚1号>DTARI;7个咖啡品种的气孔导度呈"J型"曲线变化趋势,其日均气孔导度排序为紫叶>矮卡>埃塞俄比亚1号>矮卡(航天)>T5175>埃塞俄比亚2号>DTAR;'矮卡'的日均水分利用率最大,而'DTARI'的最小.总之,'紫叶'具有较强的光合性能(净光合速率、气孔导度、光能利用率),但是其水分利用率较低,对干旱的适应能力不足.
小粒咖啡苗圃杂草防控药剂筛选初报
《热带农业科技 》 2019
摘要:为有效降低小粒咖啡苗圃杂草防除成本,开展了3种药剂及不同处理方法防除咖啡苗圃杂草试验.结果表明,50%敌草胺可湿性粉剂施药后5 d再移栽咖啡沙床苗,不仅可以确保杀草效果,还能确保苗木不受伤害;30%苄嘧磺隆·丙草胺可湿性粉剂采用锯末作为混制"药土"材料,杂草防除效果不仅高于河沙"药土",防除杂草效果最佳,且持效期长.