科研产出
茶树抗逆相关基因ERF的克隆与表达特性分析
《茶叶科学 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：对利用cDNA-AFLP技术所获得的茶树低温诱导差异表达片段TDF,通过RACE方法获得含完整编码区序列的茶树ERF基因cDNA克隆,其开放阅读框编码212个氨基酸,包含一个保守的结构域AP2/ERF,与多种植物ERF蛋白具有高度同源性。qRT-PCR分析表明,茶树ERF基因受低温、乙烯、脱水、NaCl等上调表达,最大表达量分别是诱导前的121.1、22.6、2.6和2.2倍。在不同组织器官中,茶树ERF基因在转录水平上存在显著差异,成熟叶片中表达最高,其次是芽,而根和茎中表达量较低且相当,花和种子中表达极低。推测该基因在茶树响应非生物胁迫中发挥重要作用以及在组织中的表达受到严格控制。
关键词： 茶树 ERF基因 基因克隆 qRT-PCR 表达分析
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香石竹坏死斑点病毒的鉴定与检测
《西南农业学报 》 2010 北大核心 CSCD
摘要：调查表明云南省昆明市团结乡香石竹普遍发生病毒病。电镜负染检测采自团结乡香石竹病毒病病样,病叶汁液中观察到弯曲长线型的病毒粒体,长度约1000~1600 nm,直径约12 nm。对这些病样的叶片进行间接ELISA检测,所有样品与香石竹坏死斑点病毒抗血清都呈阳性反应。按照报道的长线形病毒属简并引物合成引物,采用RT-PCR法对血清反应呈阳性的香石竹总RNA扩增了1059ntsHSP70基因部分编码序列,将其克隆到pMD18-T载体上,并进行序列分析。根据测序结果设计引物建立RT-PCR扩增检测方法并测定其灵敏度。结果表明,使用简并引物和新设计的引物均能从CNFV感病香石竹组织中扩增出与预期大小一致的目标片段,而健康组织无此扩增产物。灵敏性测定结果表明该特异性引物RT-PCR可从稀释106植物总RNA中检测出病毒。
关键词： 香石竹坏死斑点病毒 RT-PCR 特异引物 简并引物
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茶树冷诱导基因RAV的克隆与表达特性分析
《植物生理学通讯 》 2010 北大核心 CSCD
摘要：对利用cDNA-AFLP技术所获得的茶树低温诱导差异表达片段TDF,通过RACE方法获得含完整编码区序列的茶树RAV基因cDNA克隆,其开放阅读框编码361个氨基酸,包含两个保守的结构域AP2和B3,与多种植物RAV蛋白具有高度同源性。qRT-PCR分析表明,茶树RAV基因受低温、乙烯、NaCl等上调表达,最大表达量分别是诱导前的5.8、10.0和1.9倍。在成熟叶片、芽、嫩茎中RAV基因表达量相近,花蕾和嫩根中表达较低,而在种子中不表达。推测该基因在组织中的表达受到严格控制以及在响应非生物胁迫中发挥重要作用。
关键词： 茶树 RAV转录基因 基因克隆 qRT-PCR 表达分析
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利用RT-PCR快速检测马铃薯X病毒(PVX)
《西南农业学报 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：采用TR IZOL试剂盒和异硫氰酸胍法2种方法提取了带PVX马铃薯试管苗的总RNA。根据设计好的1对特异性引物,运用反转录PCR技术对提取的总RNA进行了体外扩增。结果表明,所用2种方法都能有效地提取马铃薯RNA,并适合于反转录合成病毒cDNA,得到了与预期大小相一致的720 bp片段,而对照未得到任何产物。但利用TR IZOL试剂盒进行RNA提取价格较贵,而异硫氰酸胍法所用试剂可自己配制,方法灵活,价格较TR IZOL试剂盒便宜。从而建立了经济简便的PVX RT-PCR检测体系,为PVX的防治、脱毒种薯和核心种苗的检测提供有效手段。
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马铃薯卷叶病毒RT-PCR-RFLP的检测分析
《云南大学学报(自然科学版) 》 2008 北大核心 CSCD
摘要：马铃薯卷叶病毒(Potato leafroll virus,PLRV)是马铃薯生产上的主要病毒病原之一,侵染马铃薯后,造成减产和品质退化.采自云南、内蒙古和贵州的马铃薯样品经过DAS-ELISA检测为PLRV阳性,经RT-PCR扩增出约350 bp的DNA片段表明感染了马铃薯卷叶病毒.进一步用HaeⅢ和StuⅠ限制性内切酶对马铃薯卷叶病毒的RT-PCR产物进行Restriction fragment length polymorphism (RFLP)分析,RFLP图谱与预期图谱相符.证实RT-PCR-RFLP方法是1种快速、准确的检测方法.
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应用特异引物和简并引物检测百合斑驳病毒
《植物检疫 》 2004
摘要：应用特异引物和简并引物对百合斑驳病毒 (LMoV)进行RT PCR检测。结果表明 ,特异引物和简并引物均能从LMoV感病百合组织中扩增出与预期大小一致的目标片段 ,而健康组织无此扩增产物 ,简并引物还能从感染TBV的郁金香病叶中扩增出目标片段。将感染LMoV组织总RNA以 1 0倍梯度稀释成不同浓度检测 ,特异引物检测的灵敏度为 1 0 -4 ,简并引物的灵敏度为 1 0 -3 。对特异引物的PCR产物进行克隆和测序 ,序列分析表明与LMoV不同分离物的序列同源性为 90 %～ 99% ,说明采用本研究确定的方法检测百合斑驳病毒结果准确可靠。
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胶原Ⅳα_1链NC1结构域基因的克隆及其在大肠杆菌中的表达
《云南大学学报(自然科学版) 》 2002 CSCD
摘要：胶原中多个成分如ⅩⅤ ,ⅩⅤⅢ的NC结构域能抑制血管内皮细胞增殖和迁移 ,具有抑制肿瘤生长和转移的活性 .从胎盘组织中提取总RNA ,根据文献报道的胶原Ⅳα1链cDNA序列 ,设计一对特异性引物 ,应用RT -PCR方法扩增出胶原Ⅳα1链NC1结构域基因 .DNA序列测定发现 ,扩增得到的基因与文献报道序列存在单个核苷酸变异 (A132C) ,编码氨基酸 (Gly)不变 .将扩增得到的胶原Ⅳα1链NC1结构域基因克隆到原核表达载体 pPROEXHTb上 ,并在大肠杆菌BL2 1中进行体外表达
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血管生成抑制因子canstatin基因的克隆及表达
《云南大学学报(自然科学版) 》 2001 CSCD
摘要：Canstatin是最近发现的能抑制新生血管生成和肿瘤生长的又一血管生成抑制因子 .从胎盘组织中提取总RNA ,根据已知canstatin基因序列 ,设计特异引物 ,应用RT -PCR方法扩增出该基因片段 .DNA序列测定表明 ,与文献报道的该基因比较 ,核苷酸序列完全一致 .将扩增得到的该基因克隆于原核表达载体 pPROEX HTb中 ,在大肠杆菌E .coliBL2 1中经IPTG诱导获得了表达 ,表达量约占菌体总蛋白量的 2 0 %以上 .
关键词： canstatin基因 新生血管生成抑制 RT-PCR 表达
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