科研产出
云南薏苡种质资源农艺性状的主成分和聚类分析
《植物遗传资源学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：为了揭示云南薏苡种质资源多样性,发掘薏苡资源中的有益基因,利用主成分分析和聚类分析,对收集的65个薏苡种质资源的13个农艺性状进行多样性评价。结果表明,云南薏苡资源存在丰富的遗传多样性,其中栽培种的分枝数和分蘖数的遗传变异系数分别达到57.4%和47.5%,野生种百粒重的遗传变异系数达到60.4%。应用主成分分析将云南薏苡13个性状简化为7个主成分,其累积贡献率为85.67%,以叶片宽因子贡献率最高,为49%。采用系统聚类分析,将65份供试材料在遗传距离16.21水平上聚为5个大类,可区分为株高较矮叶片较短型、株高较高叶片较长型以及3个特殊型。
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2种判别方法对黑木耳产地分类的比较研究
《山西农业科学 》 2015
摘要：采用云南、贵州、四川、福建、广西、黑龙江6个不同产地的黑木耳样本,通过ICP-MS,以镧、铈等16种稀土元素为指标,进行Fisher判别分析(FDA)和聚类分析,并比较了二者的性能优劣。结果表明,通过聚类分析,云南、贵州、四川的样品存在混聚现象,分类效果不是很好;通过Fisher判别分析,对初始案例中95.1%进行了正确判断,交叉验证分析成功率为93.3%,对36个外部验证样本进行判别回代,正确率为90.1%。Fisher判别分析方法具有突出的维数约减能力,能有效地融合训练数据的类别信息,并按照分类能力提取特征,所呈现的分类效果明显优于聚类分析方法。因此,基于稀土元素的Fisher判别分析方法可以有效地对黑木耳的产地进行分类。
关键词： 黑木耳 Fisher判别分析 聚类分析 稀土元素
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南瓜种质资源农艺性状的主成分及聚类分析
《长江蔬菜 》 2015
摘要：对37份南瓜种质资源主要农艺性状进行主成分分析和聚类分析。分析结果表明,南瓜种质27个农艺性状变异系数幅度为5.50%~69.44%,平均变异系数为26.86%,Shannon多样性信息指数平均值为1.667,老瓜纵径Shannon多样性信息指数最高,为2.273;瓜面特征最低,为0.785。综合来看,数量性状多样性信息指数要高于质量性状;主成分分析结果显示,第1、第2、第3主成分的方差贡献率分别为20.89%、13.64%和10.28%,累积贡献率44.81%;聚类分析结果表明,可以将37份南瓜种质分为三大类,其中第1类1份材料,第2类也为1份材料,其余为第3类,共35份材料。
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云南苦荞资源农艺性状的主成分和聚类分析
《江西农业大学学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：为揭示云南苦荞种质资源多样性,发掘苦荞资源中的有益基因,利用主成分分析和聚类分析,对收集的63个苦荞种质资源的12个农艺性状进行了多样性分析。结果表明,在云南苦荞资源中遗传多样性很丰富,其中株粒质量的遗传变异系数达到33.2%。应用主成分分析将云南苦荞12个性状简化为7个主成分,其累积贡献率为89.14%。采用系统聚类分析,将63份供试材料在遗传距离19.39水平上可聚为3个大类,可区分为生育期较长型、生育期中等、生育期较短型。其中第2类的株高适中、生育期适中、千粒质量大,综合性状表现较好,是选育优良品种(系)的理想材料。
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红花种质资源形态性状遗传多样性分析
《热带作物学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：为促进红花品种改良及种质资源的高效利用,以筛选出的68份优异种质为材料,对19个形态性状进行调查分析,研究其遗传多样性。利用主成分分析和聚类分析,结果表明:国内外不同地理来源红花资源群体间的遗传多样性丰富,数量性状上存在较大变异。主成分分析以5个主成分因子反映了13个数量性状的全部信息。累计贡献率达85.08%,各主成分包含的信息具有一定的相关性,表明主成分分析结果与参试资源和性状指标的选择均有关系。将主要农艺性状归纳为产量构成因子,生长势因子和子粒因子。采用DPS 7.0软件,进行系统聚类分析,根据19个性状在红花种质资源间的不同表现,在遗传距离13.29处将68份供试材料聚为7大类群。聚类结果表明,不同地理来源的种质资源多样性较丰富,聚类分析中部分地理来源相同或遗传背景相似的资源能够聚在同一类群,但也有一些地理来源及遗传背景不一致的种质资源也聚在同一类群,少部分资源品种表现差异大,表明品种类群间的性状分化与地理分布既有一定的联系又不绝对相关,即不同地区的材料聚类呈现一定的地理分布规律。研究结果表明:供试的红花种质资源具有丰富的遗传多样性,其中多样性指数最高的是分枝总数为15.779 2,其次为单株有效果球数、单株产量和分枝长度,依次为15.673 9、10.617 5和10.4155,多样性指数越高,表明遗传多样性越丰富。实践证明在杂交或其他方法育种中,选配亲本材料应依据主成分的排序,具体分析与全面评价每个亲本材料综合指标的优劣,依据红花育种目标,结合聚类分析,合理地选配组合。对于红花品种改良及资源的进一步开发利用具有重要意义。
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25份国外蓖麻种质资源主要农艺性状的聚类分析及评价
《分子植物育种 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：本研究以25份国外蓖麻种质资源为材料,对11个主要农艺性状进行相关及聚类分析。结果表明:一级分枝穗长和一级分枝蒴果数的变异系数(CV)最大,分别为89.2%和94.1%;百粒重的变异系数最小,为20.4%。通过相关性分析结果表明对蓖麻产量贡献最大的农艺性状是单株总蒴果数,其次是单株有效穗、百粒重以及一级分枝蒴果数;基于各种质间性状的遗传差异,在距离为5时,把25份蓖麻聚类并划分为6大类群,可为杂交育种根据不同类别的特点利用亲本提供依据。
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基于TOPSIS法和聚类分析法的树莓品种的综合评价
《江西农业学报 》 2015
摘要：利用Topsis法和聚类分析法优势互补的特点,对18个树莓品种进行了综合评价,筛选出不同类群内优势种源,结果表明:在TOPSIS综合评价中,排在前9位的优势品种都分布在第I类群和第IV类群中。在第I类群中有Fengmanhong、Boysen、No-thorn black raspberr,在TOPSIS综合评价中分别居第2、第8、第1位;在第IV类群中有Chilcotin、Willamette、Reville、Tulameen、Vera、Kredo,在TOPSIS综合评价中分别居第5、3、6、4、9、7位。由聚类分析可知,第I类群和第IV类群的亲缘关系最远,如果用第I类群中的优势种源与第IV类群中的优势种源进行杂交组合设计,更容易在今后的育种工作中选出优势的杂交后代。
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云南重楼种质资源农艺性状的聚类分析
《江西农业学报 》 2015
摘要：为了探明云南重楼种质资源的遗传多样性和亲缘关系,对云南省农业科学院高山经济植物研究所资源圃保存的23份云南重楼的16个农艺性状进行了观测,并用聚类法加以分析,结果表明:16个农艺性状具有较大的变异潜力,变异系数以3年芽增加数的变异幅度最大,为117.47%,其次是花瓣宽,为36.37%,最小的是萼片长,为13.80%。23份云南重楼种质资源的卡方距离变化范围在0.1973~2.4497,平均为1.3235。聚类分析在卡方距离为9.000处把供试材料分为4组,各组都具有一定的特点,聚类分析将地理距离相近的材料都聚为了一类,这更有利于育种亲本选择。
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野生和栽培滇龙胆主要活性组分含量特征及质量评价
《药物分析杂志 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：目的:建立滇龙胆高效液相色谱(HPLC)图谱,测定有效成分含量,结合化学计量学对野生和栽培药材进行质量评价。方法:采用Shim-pack VP-ODS液相色谱柱(150 mm×4.6 mm,5μm),以0.1%甲酸水溶液(A)-乙腈(B)为流动相,梯度洗脱(0~5 min,5%B;5~10 min,5%B→10%B;10~26 min,10%B→26%B;26~30 min,26%B→35%B),流速1.00 m L·min-1;柱温30℃;检测波长241 nm,进样量5μL。采用系统聚类,相似度分析和偏最小二乘判别对化学数据进行统计分析。结果:27批药材马钱苷酸含量为5.375 mg·g-1(S12)~20.234 mg·g-1(S3),獐牙菜苦苷含量为2.246 mg·g-1(S7)~9.653 mg·g-1(S18),龙胆苦苷含量为24.252 mg·g-1(S19)~128.350 mg·g-1(S25),当药苷含量为0.510 mg·g-1(S12)~3.498 mg·g-1(S8);当药苷在4种活性成分中含量最低;所有样品依照4种化学成分的含量特征可分为a、b、c 3类;a类包括大部分野生样品和栽培2年的滇龙胆,贵州的样品(S19)被单独归为b类,c类主要为3年生样品;相似度分析显示大部分样品相似度大于0.930,野生和栽培样品化学成分种类相似,但含量有明显变化;以14个共有峰峰面积为变量,进行偏最小二乘判别分析,建立PLS-DA模型,结果显示野生和栽培样品能被正确区分;栽培3年滇龙胆环烯醚萜与裂环烯醚萜类成分总含量最高,质量稳定,品质最佳。结论:高效液相色谱图谱与多指标化学成分定量相结合可为野生和栽培滇龙胆药材质量控制和评价提供科学依据。
关键词： 滇龙胆 环烯醚萜 裂环烯醚萜 聚类分析 野生样品 栽培样品 特征图谱分析 马钱苷酸 獐牙菜苦苷 龙胆苦苷 当药苷
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云南罗望子种质资源植物学性状比较研究
《热带作物学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：对16份罗望子种质资源进行了植物学性状比较研究,结果表明:不同地理来源的罗望子在植株、叶片、花、果实、种子等植物学形态特征上均存在不同程度的差异性。主成分分析表明:冠幅、冠型、树势、复叶主轴粗度、小叶长、花序长度、花序宽度、花冠直径、萼片长宽比、萼筒宽度、萼筒深度、果肉厚、果实曲线长度、纤维数、纤维重为罗望子的种质资源植物学多样性的主要指标,通过筛选初步将叶长、叶宽、花序长度、花序宽度、花冠直径、单果重、果实直线长度、果实曲线长度、果肉厚度、纤维数、果肉剥离难易程度、种子数量这几个性状作为罗望子种质资源植物学描述评价的代表性状,便于罗望子种质资源的描述和评价;通过聚类分析,16份材料分为6大类群,为罗望子种质种质资源的遗传多样性分析、植物学性状描述规范的制定和新品种的选育奠定基础。
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