科研产出
基于全基因组测序一株自然形成的耐链霉素果胶杆菌NJAU2的分离鉴定
《植物病理学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：果胶杆菌属（Pectobacterium）是导致全球农作物经济损失的重要病原细菌之一，抗生素抗性菌株的产生加大了该病害的防控难度。本研究以不同寄主植物分离获得的果胶杆菌为材料，利用平板分析，获得一株野外形成的链霉素抗性菌株。通过基因组测序及比较基因组研究，明确其分类地位，并预测链霉素抗性基因。研究表明，自不同寄主分离的8个菌株中，云南黄花马蹄莲发病株获得的NJAU2,对链霉素存在高度抗性。NJAU2基因组总长5 062 459 bp, GC含量51.83%,N50长度306 378 bp,共有4 568个编码基因。基于果胶杆菌8个管家基因（fliA、fusA、glyA、gyrB、purA、rpoA、rpoS和secY）的MLSA多位点序列分析结果显示NJAU2与标准菌株P.aroidearum SCRI 109T及已报道的菌株P.aroidearum PC1聚类在同一个分支，该结果与基于16S rRNA基因序列构建的系统发育关系一致，进一步NJAU2与各果胶杆菌的平均核苷酸一致性（ANI）、DNA-DNA杂交（isDDH）分析也支持这一结果。为此，将自然形成的链霉素耐性菌株NJAU2归属于果胶杆菌的新种：Pectobacterium aroidearum,命名为Pectobacterium aroidearum NJAU2。NJAU2的基因组中携带编码链霉素耐药基因集。抗生素耐药性综合数据库（CARD）比对发现NJAU2含有与7类耐药相关的328个耐药基因。此外，NJAU2基因组注释表明：其含有15个编码氨基糖苷类抗生素抗性基因，其中与链霉素抗性相关的基因有rpsL和gidB。马蹄莲软腐病病原菌NJAU2的发现，为果胶杆菌在链霉素抗性方向的研究提供了新材料。
关键词： Pectobacterium aroidearum NJAU2 鉴定 链霉素抗药性 基因组分析 抗性基因
全文链接
请求原文
有机物料添加对菜地土壤氮素转化和温室气体排放的影响
《中国土壤与肥料 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为了探讨菜地土壤氮转化速率及其对不同有机物料添加后的响应特征，为菜地土壤合理施肥提供科学依据，以洱海流域典型菜地土壤为研究对象开展室内培养试验（25℃，田间持水量的60%,5 d），采用15N同位素成对标记技术和氮转化速率计算模型研究了土壤无机氮含量变化和氮转化速率及其对秸秆、生物炭和牛粪3种有机物料添加的响应。结果表明：（1）菜地土壤铵态氮和硝态氮含量随培养时间均呈降低趋势，有机物料添加后降低了土壤无机氮含量。（2）5 d培养期间土壤的平均初级氮矿化速率、初级硝化速率、NO3-消耗速率和NH4+固定速率分别为-28.5、-3.93、1.52和11.9 mg·kg-1·d-1。菜地土壤矿化速率和硝化速率均为负值，土壤以氮的微生物固定为主。（3）有机物料添加后土壤氮矿化速率增加，虽然速率仍为负值，但秸秆添加效果显著。秸秆添加还显著降低了土壤初级硝化速率，但有机物料添加后NH4+固持速率增加，特别在秸秆和生物炭添加后显著增加。（4）秸秆添加显著增加了土壤N2O和CO2排放量，生物炭添加有降低土壤N2O和CO2排放量的趋势但无显著影响，牛粪添加也无显著的影响。对于洱海流域菜地土壤，高碳氮比（C/N）的有机物料添加能增加氮微生物固定作用，但随着时间增加，有机物料有增加矿化作用的趋势，其中生物炭一定程度上降低了土壤CO2和N2O排放量，且增加菜地土壤无机氮含量进而提升其土壤氮供应能力。由此可见，在洱海流域菜地土壤优化施用高C/N的有机物料，科学施肥，能维持土壤的供氮能力，确保菜地土壤的可持续利用，还可能降低温室气体排放。
关键词： 有机物料 氮转化速率 温室气体 秸秆 生物炭 牛粪
全文链接
请求原文
云南省苹果褐座坚壳菌分布及其对杀菌剂的敏感性
《植物保护学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为明确云南省苹果根腐病主要致病菌褐座坚壳菌Rosellinia necatrix的分布及其对5种常用杀菌剂的敏感性，从云南省6个州（市）15个县（区）苹果种植区采集210份根腐病典型样品，采用组织分离法进行病原分离，并利用rDNA ITS基因序列比对进行分析鉴定，采用菌落生长速率法测定各地区代表菌株对蛇床子素、吡唑醚菌酯、咪鲜胺、甲基硫菌灵和噁霉灵5种杀菌剂的敏感性。结果表明：经分离纯化共获得236株菌株，其中褐座坚壳菌的分离频率为70.76%，其在昆明市富民县、石林县、禄劝县，曲靖市马龙区、麒麟区，昭通市朝阳区、鲁甸县，红河哈尼族彝族自治州蒙自市、弥勒市，丽江市古城区和大理白族自治州大理市、洱源县、剑川县、漾濞县的14个县区均发生危害。药剂敏感性测定结果显示，蛇床子素、吡唑醚菌酯、咪鲜胺、甲基硫菌灵和噁霉灵EC50范围分别为5.08～457.69、0.28～6.49、0.12～6.59、0.35～3.51和3.51～140.53 mg/L；频次正态分布敏感性分析发现褐座坚壳菌对蛇床子素、吡唑醚菌酯、咪鲜胺、甲基硫菌灵和噁霉灵呈现左正偏态，表明出现了敏感性降低的亚群体；敏感性聚类分析结果表明，云南省苹果褐座坚壳菌对药剂的敏感性有地域性差异；相关性分析结果表明，褐座坚壳菌对咪鲜胺和吡唑醚菌酯敏感性存在正相关，出现双抗现象。说明褐座坚壳菌是引起云南苹果种植区根腐病发生的主要病原菌。
全文链接
请求原文
褪黑素诱导西伯利亚百合的转录组分析及LoERF96基因克隆
《云南农业大学学报(自然科学版) 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】研究西伯利亚百合萌发阶段的分子调控机制，筛选响应褪黑素、促进百合鳞茎萌发的潜在乙烯响应因子(ethylene response factor,ERF)。【方法】对褪黑素处理下的西伯利亚百合小鳞茎关键时期样本进行转录组测序分析，并对差异表达基因进行功能注释，筛选响应褪黑素、促进百合鳞茎萌发的ERF潜在基因。对筛选的关键基因LoERF96进行克隆和生物信息学分析，通过实时荧光定量分析小鳞茎4个不同生长发育时期中LoERF96基因的表达量。【结果】根据转录组数据筛选得到780个差异表达基因，其中上调表达基因392个，下调表达基因388个。GO富集分析结果显示：富集的差异基因主要生物学过程包括代谢过程、细胞过程、生物调节、刺激响应、信号、生殖过程等。KEGG代谢途径分析结果显示：差异基因的代谢途径包括植物激素信号转导、植物MAPK信号途径、苯丙烷生物合成、淀粉和蔗糖代谢、光合作用、碳代谢、内质网中的蛋白质加工等。通过同源克隆得到LoERF96基因，该基因序列全长435 bp，编码144个氨基酸，有1个AP2保守结构域，蛋白相对分子质量约为16.32 ku，理论等电点为4.94，是没有跨膜结构的亲水性蛋白，预测亚细胞定位于细胞核中。RT-qPCR表达结果显示：在百合4个不同生长发育过程中，LoERF96基因的相对表达量总体呈先上升后下降的趋势。【结论】西伯利亚百合中的乙烯响应因子LoERF96受褪黑素诱导表达，这一结果为探究百合AP2/ERF转录因子萌发阶段的生物学功能提供了理论基础和参考。
关键词： 百合 LoERF96 基因克隆 转录组 生物信息学分析
全文链接
请求原文
叶锈病不同危害等级下咖啡叶片的光合特征和抗逆性酶比较
《作物杂志 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为探讨小粒咖啡侵染叶锈病后的生理生化变化,对8个叶锈病危害等级下叶片的落叶率（LF）、叶绿素相对含量（SPAD）、光合参数及4种抗逆性酶活性进行测定,分析叶锈病不同危害等级对咖啡叶片生理落叶、光合作用及抗逆性的影响。结果表明,LF随着叶锈病感染面积的增加而增加,SPAD随着叶铸病感染面积的增加先升高后降低。危害等级Ⅲ的净光合速率（P_n）、气孔导度（Gs）、蒸腾速率（Tr）最大,危害等级Ⅶ的胞间CO2摩尔分数（Ci）最大。危害等级0的水分利用率(EWU)最高,与危害等级Ⅰ间差异不显著,但显著高于危害等级Ⅱ～Ⅶ。危害等级Ⅳ的光能利用率(LUE)最高,与危害等级Ⅱ和Ⅲ间差异不显著,但显著高于其余5个危害等级的。危害等级0～Ⅵ下超氧化物歧化酶活性变化不明显;受咖啡叶铸病感染后,均能一定程度提高过氧化物酶活性;几丁质酶（CHT）和β-1,3-葡聚糖酶（β-1,3-GA）的活性均随危害等级的增加先升高后降低,在危害等级Ⅲ下CHT和β-1,3-GA的活性最大。综合分析表明,危害等级Ⅲ下咖啡叶片具有更高的光合作用和抗逆性,落叶相对较少。
全文链接
请求原文
耐热、抗根肿病、萝卜胞质雄性不育(Ogura CMS)大白菜材料的创制
《湖北农业科学 》 2024 北大核心
摘要：为获得耐热、抗根肿病的Ogura胞质雄性不育(Ogura CMS)大白菜(Brassica rapa L.ssp.Pekinensis)材料,以耐热大白菜为母本,抗根肿病娃娃菜为父本获得F1,经鉴定后和抗根肿病Ogura胞质雄性不育娃娃菜杂交,获得CMSF1,再将F1自交获得的F2经鉴定筛选后作为父本,CMSF1鉴定筛选后作为母本进行回交,得到BC1.抗根肿病表型鉴定结果显示F1、CMSF1、BC1表现为抗病,分子标记鉴定结果显示,F1植株均携带根肿病抗性基因,CMSF1 和BC1 大部分植株携带根肿病抗性基因.耐热鉴定结果表明,F1、CMSF1、BC1在高温胁迫下超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)和过氧化氢酶(CAT)的活性增幅大于迷您黄1号.CMSF1和BC1花器官观察结果表明雄蕊败育无花粉,是Ogura胞质雄性不育株.
关键词： 大白菜(Brassica rapa L.ssp.Pekinensis) 根肿病 耐热 Ogura胞质雄性不育
全文链接
请求原文
化肥减量配施生物有机肥对云当归产量与品质的影响
《中药材 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：目的：探讨生物有机肥对云当归成药栽培的影响。方法：采用双色膜覆盖开展云当归成药田间栽培试验，设置不施肥（CK）、常规施肥（NF）、单施化肥（C）、单施生物有机肥1号（BF1）、单施生物有机肥2号（BF2）、50%化肥+生物有机肥1号（50%C+BF1）、50%化肥+生物有机肥2号（50%C+BF2）7个处理，探讨不同施肥处理对土壤养分含量、云当归成药根农艺性状、产量和品质的影响。结果：施用生物有机肥处理的土壤有机质、碱解氮、有效磷和速效钾含量较CK分别提高8.76%～12.83%、7.02%～10.69%、26.35%～88.25%和126.93%～219.01%;施用生物有机肥能提高云当归主根长、根粗、侧根数、单株鲜重及干重，显著提高云当归鲜、干药材产量（P<0.05）,分别较CK增产35.17%～94.28%、29.53%～80.74%,其中，50%C+BF1处理鲜、干产量最高，50%C+BF2处理次之；施用生物有机肥可提高云当归药材挥发油、阿魏酸、多糖和醇溶性浸出物含量，降低总灰分含量，有效改善云当归药材品质。结论：综合土壤养分含量、云当归成药根农艺性状、产量和品质，该试验条件下，以50%C+BF1处理效果最佳，能促进维西县云当归的高产优质。
全文链接
请求原文
有机物料输入对作物土传病害防控作用的Meta分析
《植物营养与肥料学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：[目的]探究外源有机物料输入对作物土传病害的防控效应.[方法]在Web of Science、Springer、中国知网(CNKI)、万方、维普、Google Scholar等中英文数据库,以"长期定位试验"、各类有机肥、主要土壤理化性状指标和 5 种常见病虫害为关键词,筛选出研究地点在中国的论文 128 篇,提取有效田间数据 953 组.此外,于云南省保山市、丽江市和石林县 209 个地块采集土壤样品,测定包括有效态中、微量元素在内的土壤理化性质,微生物生物量碳氮含量以及酶活性,共获得田间试验数据 297 组.采用相关性分析和结构方程模型探究土壤主要化学和生物学指标与作物土传病害发生的关系,采用Meta分析评估有机物料输入对各指标的影响.[结果]有机物料输入可显著提高酸性土壤pH和有机质、有效磷、速效钾、水解氮含量,显著降低盐碱土pH(P<0.05),提高交换性钙、交换性镁、有效锌、有效铜、有效铁、有效锰和有效硼含量,降低交换性铝含量(P<0.05),显著提高土壤脲酶、酸性磷酸酶、蔗糖酶、β-葡萄糖苷酶和过氧化氢酶活性以及土壤微生物生物量碳和氮含量(P<0.05).有机物料输入对作物土传病害发病率具有抑制作用,发病率平均可显著降低 49.7%(P<0.05),且对细菌性和真菌性土传病害的抑制效果显著高于对线虫性土传病害的效果;此外,结构方程模型和Meta分析表明,土壤pH降低是作物土传病害发生的重要驱动因素.相关性分析表明,土壤有机质、有效磷、交换性钙、交换性镁、有效硼以及土壤蔗糖酶活性与土壤pH呈显著正相关(P<0.05),土壤pH与土壤交换性铝呈显著负相关(P<0.05).[结论]有机物料输入可显著提高土壤养分含量、酶活性以及微生物生物量碳和氮含量;并可通过降低土壤交换性铝含量,提高土壤有机质、有效磷、交换性钙和交换性镁等含量以及土壤β-葡萄糖苷酶和蔗糖酶活性,降低作物土传病害发病率.
关键词： 有机物料 土壤化学性质 土壤生物学性质 土传病害 Meta分析
全文链接
请求原文
蒜芥茄PR-10基因的克隆与表达分析
《热带作物学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：黄萎病是由轮枝菌属(Verticillium spp.)真菌引起的一种土传病害,是茄子生产中的重要病害之一,严重影响茄子的产量和品质.目前,对于茄子黄萎病的防治还限于嫁接和化学防治,但二者均不能较好防止该病的发生,而挖掘茄子中黄萎病抗性基因,结合基因工程技术培育抗病品种,是防治黄萎病的最佳途径.蒜芥茄(Solanum sisymbriifolium Lam.)为云南野生茄,对黄萎病具有高抗性.PR基因是编码植物病程相关蛋白(pathogenesis related protein)的基因,与植物抗病防御密切相关,其中,PR10 蛋白是具有核酸酶相似结构的一类蛋白,但其在蒜芥茄中的抗病作用机制尚不明确.本研究以蒜芥茄为试验材料,利用前期建立的蒜芥茄转录组数据库,通过RT-PCR技术从中分离并克隆得到PR10同源基因,命名为SsPR-10,测序得到 645 bp,其中基因编码区长 480 bp,共编码 159 个氨基酸.将测序得到的编码区序列进行生物信息学分析,结果显示:SsPR-10 蛋白是分子量为 17.71 kDa、等电点为 5.54 的酸性亲水蛋白;跨膜区和信号肽预测显示 SsPR-10 蛋白无跨膜区和信号肽;亚细胞定位结果表明 SsPR-10 定位于细胞质;保守结构域预测结果显示,SsPR-10 含有"P-LOOP"环(47~52 位)和保守序列PATHOGENESIS_BETVI(88~120 位).序列比对与系统进化树分析结果表明,SsPR-10 蛋白与黄果茄PR10 蛋白同源性最高,其次是马铃薯STH-2 蛋白.通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术对SsPR-10基因的表达进行分析,SsPR-10在蒜芥茄根部的表达量最高,具有组织特异性;在接种大丽轮枝菌(V.dahliae)24 h后,SsPR-10的表达量达到初始表达量的 8.16 倍,表明黄萎病病菌可能诱导SsPR-10的表达.本研究对野生蒜芥茄PR-10基因进行了克隆和表达分析,为进一步研究SsPR-10基因响应黄萎病等生物胁迫的机制提供一定的理论基础.
全文链接
请求原文
大麻(Cannabis sativa L.)内生细菌的分离与鉴定
《分子植物育种 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为分离与鉴定大麻（Cannabis sativa L.）雌株及雄株3个部位的叶片（从植株茎基向茎尖方向第二轮叶,第五轮叶,雄花周围叶）和花的内生细菌，本研究采用微生物培养和分子生物学鉴定方法，探讨其种类及其分布特征。结果显示，从大麻雄株中分离到6属35株内生细菌，大麻雌株中分离到11属39株内生细菌。内生细菌种属在大麻雌雄植株不同部位的叶和花中的分布存在显著差异，大麻雌株与雄株的内生细菌种类只共有葡萄球菌属（Staphylococcus sp.）、芽孢杆菌属（Bacillus sp.）和马赛菌属（Massilia sp.），其余均不共有。大麻雄株3个部位叶片中共有阿尔莱特葡萄球菌和溶血葡萄球菌而雄花中不存在；在雄花中分离到地衣芽孢杆菌、木糖葡萄球菌和贝莱斯芽孢杆菌而叶中不存在。大麻雌株3个部位叶片共有贝莱斯芽孢杆菌和特基拉芽孢杆菌而雌花中不存在；在雌花中分离到粪短波单胞菌、谷粒申氏菌、农杆菌、香料葡萄球菌、缺陷短波单胞菌、地衣芽胞杆菌和弗留明拜叶林克氏菌而叶中不存在。结果表明大麻内生细菌在不同植株、叶和花中的多样性以及不同内生细菌的分布差异。本研究结果为进一步研究大麻内生细菌的多样性提供科学依据，同时为未来大麻内生菌功能性促生菌种的筛选提供基础。
全文链接
请求原文
