二十二个抗稻瘟病基因在云南的利用价值评价

李进斌; 李成云; 陈艳; 雷财林; 凌忠专; 《植物保护学报 》 2005 北大核心 CSCD

摘要：为了明确22个抗稻瘟菌基因在云南省的抗性水平及其利用价值,将采集、分离自云南省3个稻区的282个稻瘟病菌单孢菌株,接种于以丽江新团黑谷为轮回亲本培育而成的含有22个垂直抗性基因的水稻单基因系上。根据各稻区采集的菌株在水稻单基因系上的侵染率,分析出各垂直抗性基因在云南省各稻区的利用价值。持有 Pi9、Piz~5、Pil、Pita~2、Piz、Pik~h、Piz~t7个垂直抗性基因的单基因系的侵染率分别为1.22％、2.40％、3.21％、4.82％、5.95％、7.23％、9.04％,可在籼稻区种植或作抗源使用;持有 Pi9、Piz~5、Pil、Pita~2、Piz、Pik~h、Piz~t、Pil2、Pita、Pib10个垂直抗性基因的单基因系的侵染率分别为0.93％、16.67％、10.19％、5.09％、15.74％、15.74％、12.04％、9.26％、19.29％、11.11％,可在粳稻区种植或作抗源使用;持有 Pi9、Piz~5、Pil、Pita~24个垂直抗性基因的单基因系的侵染率分别为8.60％、13.83％、10.93％、18.04％,可在籼粳交错区种植或作抗源使用。同时用联合致病性系数和联合抗病性系数分析了病菌和单基因系的群体互作以及抗瘟组合的利用价值,结果表明:品种两两搭配后的 RAC 值大于0.80的组合有 Pi9与 Pita~2、Piz~t、Pil、Piz,说明以上4种组合的抗病性最强,应用价值最大。

关键词： 稻瘟病菌 毒力频率 联合致病性系数 联合抗病性系数

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稻瘟病菌阅读框架中SSR频率、分布及所在基因功能

李成云; 李进斌; 周晓罡; 张绍松; 董爱荣; 许明辉; 《中国水稻科学 》 2005 北大核心 CSCD

摘要：在对稻瘟病菌基因组中SSR分布进行了系统分析的基础上,对由1~6个碱基为重复单元的SSR在基因的蛋白质编码区中的分布进行了分析。结果表明,该病原菌的2 378 个基因的编码区中共分布有3 240 个SSR序列(标准是15bp以上,匹配值为80%)。在已经有注释的4 732个基因中,861个基因的编码区中有SSR。编码区中的SSR以三碱基重复和六碱基重复为主,其他类型的SSR则很少在编码区中出现。SSR在这些基因中很少有保守性,表明这些基因的高度变异,或者起源是较晚的。含有SSR的基因多为转录蛋白、信号传导的细胞调节基因这一现象表明,SSR在物种形成过程中有重要作用。利用基因编码区中丰富的SSR序列信息及其变化带来的功能变化的信息,将可以在该菌功能基因组的研究中发挥十分重要的作用。

关键词： 稻瘟病菌 基因组 微卫星序列 分布 蛋白质编码区 功能基因组学

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酿酒酵母分泌蛋白组的计算机分析

杨静; 李成云; 王云月; 朱有勇; 李进斌; 何霞红; 刘林; 业艳芬; 周晓罡; 唐萍; 《中国农业科学 》 2005 北大核心 CSCD

摘要：结合计算机技术和生物信息学的方法,采用组合的信号肽分析软件 SignalP v3.0、TargetP v1.01、Big-PI predictor 和 TMHMM v2.0 对已公布的 6 700 个酿酒酵母(Saccaromyces cerevieiae)基因的 N-端氨基酸序列进行信号肽分析,同时系统分析了信号肽的类型及结构。结果表明,在 6 700 个酿酒酵母蛋白中,163 个为Sec-信号肽分泌蛋白,经 Sec 途径分泌。在 163 个分泌蛋白中,有 47 个的信号肽没有典型的 N-区,仅有 H-区和C-区,其余 116 个分泌蛋白的信号肽包含完整的 3 个区,即 N-区、H-区和 C-区。比较了酿酒酵母与白假丝酵母菌(Candida albicans)分泌蛋白信号肽的氨基酸组成顺序,表明酿酒酵母与白假丝酵母菌的信号肽的氨基酸组成和顺序差异很大,两者信号肽长度分布范围、氨基酸种类及其出现频率大体一致。在酿酒酵母分泌蛋白中出现了少数氨基酸组成完全一致的信号肽,为进一步确认具有相同信号肽的分泌蛋白是否具有同源性,分别采用 BLAST 2SEQUENECES 和 CLUSTAL W 对具有相同信号肽的分泌蛋白进行了序列比对。结果表明具有相同信号肽的分泌蛋白同源性非常高,氨基酸组成也非常保守。由此可以推断,编码这些分泌蛋白的基因属于旁系同源基因(paralogous)。酿酒酵母作为一种模式生物,以其诸多的优点,被认为是表达?

关键词： 酿酒酵母 分泌蛋白 信号肽 分泌途径

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粗糙脉孢菌基因组中的微卫星序列的组成和分布

李成云; 李进斌; 周晓罡; 张绍松; 许明辉; 《中国农业科学 》 2004 北大核心 CSCD

摘要：利用已经公布的粗糙脉孢菌基因组测序结果,对该真菌基因组中的微卫星(SSR)序列进行了系统分析。结果表明,在已经公布的38.0　Mb 的基因组序列中,共有14 788 个以1～6个核苷酸为基序的 SSR序列(长度大于15　bp,匹配值大于80%),其碱基总数占整个基因组碱基数的 0.95%,平均2.57　kb 就分布有一个大于15　bp的SSR。其中数量最多的三碱基 SSR,数量达到 4 729个,其次为六碱基 SSR　(2 940个)和单碱基 SSR(2 489 个),这3 类SSR 总数达10 158 个,占 SSR总数的68.7%。数量最少的是二碱基SSR,只有691 个。在可读框(ORF)中的SSR总数为 4 094个,共分布于2 373个 ORF中,其中只有1 个SSR 的ORF为 1 056个。与其它生物内 SSR的分布类似,在基因编码区中,以三碱基SSR和六碱基SSR占绝对优势,分别为基因组中三碱基和六碱基SSR总数的54.1%和48.8%,由于ORFs和编码区的碱基总数分别为该菌基因组碱基总数的约46%和38.3%,　所以这两种长度的SSR在编码区中的密度高于基因组中的平均密度。ORF上下游300　bp调控区域内是各类SSR相对的富集区。尤其是上游区域中的五碱基SSR,为平均密度的3倍,二碱基SSR和四碱基SSR的密度也是基因组中平均密度的2倍多。在下游调控序列中,五碱基、四碱基、二碱基、单碱基 SSR的密度,也大大超过了在基因?

关键词： 粗糙脉孢菌 基因组 微卫星序列 频率 分布 遗传标记

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稻瘟病菌基因组中微卫星序列的频率和分布

李成云; 李进斌; 周晓罡; 董爱荣; 许明辉; 《中国水稻科学 》 2004 北大核心 CSCD

摘要：利用已经公布的稻瘟病菌基因组测序结果 ,对该植物病原真菌基因组中的微卫星 (SSR)的类型、大小及分布进行了系统分析。在已经公布的 37.89Mb的基因组序列中 ,共有 16 398个由 1～ 6个核苷酸为基序的SSR序列 (匹配值为80 % ) ,其总长度占整个基因组碱基数的 0 .87% ,平均 2 .31kb碱基中就分布有 1个大于 15bp的SSR。其中数量最多的是单碱基重复 ,达到 4 392个 ,其次为三碱基重复序列 (35 86个 ) ,五碱基重复序列 (344 2个 ) ,这 3种SSR总数达 114 2 0个 ,占SSR的 6 9.7%。数量最少的是二碱基重复序列 ,只有 6 80个。在整个基因组中的主要基序有A ,AG ,AC ,ACG ,AGC ,AAG ,GGC ,ACCT ,ATCC ,AAAG ,AAAAG ,AAAAT ,AAAAC ,AAAAAG ,AAAAAT和AACTAG。有的基序类型则完全没有出现。对不同超级连锁群的分析结果表明 ,各连锁群之间的SSR分布有一定差异 ,但总体上仍是较为均衡的。这些结果为稻瘟病菌的基因标记、群体结构研究、非编码区DNA序列的结构及功能研究提供了一个较好的基础。

关键词： 稻瘟病菌 基因组 微卫星序列 频率 分布 遗传标记

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马铃薯晚疫病预测模型与预警技术研究进展

孙茂林; 李树莲; 赵永昌; 李成云; R.J.Hijmans; 《植物保护 》 2004 北大核心 CSCD

摘要：介绍了马铃薯晚疫病11个预测模型和6个电脑化模型;描述了模型预测的判断标准和预警指标,并作了评价提出存在问题;讨论了建立网络化病害预测模型和实现自动预警配套技术;报道了2003年直接应用于田间马铃薯晚疫病监测技术。

关键词： 植物病虫害测报 马铃薯晚疫病 预测模型 自动化预警技术

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几丁质酶-葡聚糖酶双价基因导入滇型杂交稻恢复系提高稻瘟病抗性的研究

许明辉; 唐祚舜; 谭亚玲; 田颖川; 李成云; 张树华; 陈正华; 田文忠; 《遗传学报 》 2003 SCI 北大核心 CSCD

摘要：将含有菜豆 (Phaseoluslimensis)几丁质酶基因和烟草 (Nicotianatabacum) β 1,3 葡聚糖酶基因的pBLGC(16 5kb)质粒用基因枪法导入滇型杂交稻 (OryzasativaL .ssp .japonica)恢复系“南 2 9”中 ,总计获得 93个转化再生植株 ,以β 1,3 葡聚糖酶基因制备探针对T1 代株系进行Southern杂交分析 ,17个株系为杂交阳性 ,证实外源基因完整结构已整合到水稻基因组中 ;连续多代的PCR追踪检测证实外源基因已遗传至T4 代 ;对所获得的 6个PCR检测阳性T4代品系进行了稻瘟病菌 (Magnaporthegrisea)生理小种接种鉴定和稻瘟病大田诱发鉴定 ,结果表明 ,转基因品系对稻瘟病的抗性较受体对照大幅度提高 ,获得了稻瘟病新抗源 ,但不同品系稻瘟病抗性并不相同。

关键词： 几丁质酶基因 葡聚糖酶基因 遗传转化 杂交稻 稻瘟病

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串叶松香草水分代谢初步研究

刘仕平; 张玲琪; 魏蓉城; 李成云; 《云南农业科技 》 2003

摘要：对优质饲料串叶松香草水分代谢昼夜变化进行了测定和分析。结果表明 :串叶松香草含水量较高 ,随环境因子温度、光照和大气湿度的昼夜变化而变化 ,其生理指标蒸腾强度、含水量、伤流量和水势亦有明显的昼夜节律性。掌握其规律 ,可进一步提高该植物产量。

关键词： 串叶松香草 水分代谢 昼夜变化

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以现代企业经营理念加快农业产业化进程

钱均祥; 李成云; 王晖; 《云南科技管理 》 2003

关键词： 用现代企业经营理念 推进农业产业化经营

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转溶菌酶基因水稻稻瘟病抗谱分析

许明辉; 李成云; 李进斌; 谭学林; 田文忠; 唐祚舜; 《中国农业科学 》 2003 北大核心 CSCD

摘要：用来源于云南各地属于 4 8个稻瘟病菌 (Magnaporthegrisea)生理小种的 6 3个菌株 ,对受体品种南 2 9及其 10个T0 代转溶菌酶基因水稻植株繁衍的 36个T5代品系进行温室接种鉴定。结果表明 ,受体品种南 2 9对38.1%的菌株 (2 4个 )表现抗病 ,转基因品系对 72 %以上的菌株表现抗病 ,对稻瘟病的抗性比对照大幅度提高 ,证明溶菌酶基因对稻瘟病具有一定的广谱抗性 ;不同T0 代植株甚至同一植株繁衍的品系对稻瘟病的抗性并不相同。大田稻瘟病诱发鉴定结果证实 ,转基因水稻叶稻瘟和穗稻瘟抗性均比受体对照大幅度提高 ,但抗叶稻瘟的转基因品系不一定抗穗颈稻瘟 ,而抗穗颈稻瘟的品系一般高抗叶稻瘟

关键词： 水稻 溶菌酶基因 转基因水稻 稻瘟病 抗谱

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