科研产出
基于长尖叶蔷薇与大花香水月季转录组数据的MLO unigenes生物信息学及表达分析
《植物遗传资源学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：在对长尖叶蔷薇和大花香水月季转录组测序的基础上,利用生物信息学方法,从其转录组数据中共获得23条MLO unigenes并对其进行了分析。结果显示它们之间的氨基酸数量、碱基数、分子量差异较小,多数为疏水性蛋白,平均亲水系数为-0.157~0.190,富含亮氨酸和丝氨酸。亚细胞定位主要分布于质膜中,包含5~9个跨膜结构;二级结构主要由α-螺旋组成。其中,等电点小于7的仅有1条,2条蛋白具有信号肽。这23条MLO蛋白具有15个长度在15~50个氨基酸间的保守基序。它们的系统进化关系分析结果揭示了MLO基因在长尖叶蔷薇与大花香水月季间具有较高的同源性和保守性。将这23条unigenes与来自于月季和拟南芥的MLO基因进行聚类分析,确定了6条可能参与抗白粉病的候选基因,对这6条候选基因进一步分析发现仅有2条unigenes符合MLO型白粉病基因的典型结构特征。最后,通过q RT-PCR试验验证,结果表明:这2条候选基因的相对表达量,在受到白粉病菌侵染后呈积极上调趋势。上述研究结果表明这2条候选基因很可能参与了寄主—白粉病菌的互作过程。
关键词： 长尖叶蔷薇 大花香水月季 MLO基因 抗白粉病 生物信息学 q RT-PCR
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3种砧木嫁接对柠檬幼树光合特性的影响
《经济林研究 》 2018 北大核心
摘要：比较不同砧木嫁接的柠檬光合特性,为筛选适合柠檬嫁接的砧木提供参考依据。采用LCpro-SD全自动便携式光合测定仪分别测定枳壳、酸柚、印度莱檬嫁接的2年生柠檬幼树成熟叶片的光合日变化参数。结果表明:3种砧木嫁接的柠檬其光合特性存在显著差异,3种砧木嫁接的柠檬净光合速率(Pn)日变化曲线均为"双峰"型,存在光合"午休"现象;最大净光合速率(Pmax)在11.08~13.14μmol·m~(-2)s~(-1)之间变化,净光合速率从大到小依次为:YN1号/ZK>4号NM/ZK>4号NM/SY>YN1号/SY>YN1号/YDLM>4号NM/YDLM;枳砧/云柠1号柠檬的光合性能最好,其最大净光合速率(Pmax)、气孔导度(Gs)、水分利用效率(Wu)、光能利用效率(Lu)和叶片叶绿素相对含量(SPAD值)均最高。从光合效率角度评价,枳壳作为云柠1号柠檬嫁接砧木效果最佳。
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坚龙胆药材产品质量分级标准研究
《中药材 》 2018 北大核心
摘要：目的:通过测定坚龙胆产品主要性状和主成分含量,探讨其产品主要性状与质量评价指标的相关性以及初步确立质量分级标准划分的合理性,为制订坚龙胆的质量标准提供实验依据。方法:使用SPSS和DPS统计分析软件,对所测数据进行K-均值聚类和相关性分析。结果:坚龙胆产品主成分与产品的5个主要性状关联度由大到小依次为根粗>须根数>根及根茎长>根及根茎鲜重>根及根茎干重,坚龙胆产品质量可分为3个等级。坚龙胆的5个产品主性状中,与有效成分关联度最大的是根粗,关联度为0.7943,而根及根茎鲜重和根及根茎干重对有效成分含量的关联度相对较小,约0.5。结论:生产中应把根粗作为高产和高有效成分含量的重点选择性状。坚龙胆产品质量的3个等级数据可为研究坚龙胆质量控制标准提供参考依据。
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APSIM-Sugar模型在云南半湿润半干旱蔗区的适应性研究
《西南农业学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：【目的】本研究对APSIM-Sugar模型在云南半湿润半干旱蔗区的适应性进行评价。【方法】从研究地区2个代表站点甘蔗大田试验获取调参验证数据集,基于标准品种Q117模型参数,采用试错法对8个关键品种参数进行优化和模拟精度评价。【结果】确定了Q208和ROC22两个甘蔗新品种的模型参数优化值,评估了模型在云南蔗区的产量糖分模拟误差范围。结果显示蔗糖产量实测值与模型模拟值显著相关,绝对误差小于2 t/hm~2,斜率在0. 8～1. 26,R~2大于0. 8。【结论】经过校验的APSIM-Sugar模型能较好模拟云南半湿润半干旱蔗区甘蔗的生长发育过程,并响应环境变化造成的产量和糖分差异,但是在多年宿根和极端环境条件下的模拟精度仍有待提高。模型品种参数和输入数据的不确定性是造成模型模拟结果不确定性的重要原因。
关键词： 甘蔗 APSIM-Sugar 调参 验证 不确定性
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粉葛中葛根素提取工艺的优化及其提取物抗氧化活性
《中成药 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：目的优化粉葛中葛根素提取工艺,并评价其提取物抗氧化活性。方法在单因素试验基础上,以料液比、提取温度、提取时间、聚乙烯吡咯烷酮(PVP)质量浓度为影响因素,葛根素提取率为评价指标,正交试验优化提取工艺。再测定粉葛提取物对·OH、O-2·自由基的清除作用。结果最佳条件为料液比1∶16,提取温度60℃,提取时间2. 5 h,PVP质量浓度45 mg/m L,葛根素提取率1. 604%。粉葛提取物对这2种自由基的清除作用显著增加。结论该方法稳定可靠,可用于提取粉葛中葛根素,并且加入助溶剂(PVP)可提高其提取物的抗氧化活性。
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猪雄性增强抗原1基因MEA1编码区克隆、表达及生物信息学分析
《云南农业大学学报(自然科学) 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：【目的】克隆猪MEA1基因编码区序列,获得基因表达谱并了解其蛋白质的基本功能。【方法】从GenBank下载猪及近缘物种MEA1序列作为参考序列,设计特异引物从版纳微型猪近交系(BMI)睾丸组织中扩增MEA1基因完全编码序列及部分侧翼序列,对MEA1翻译的蛋白质序列进行多种功能生物信息学分析并构建多物种系统进化树,最后用实时荧光定量PCR技术检测BMI 15个重要组织的MEA1 mRNA转录表达水平。【结果】扩增得到BMI MEA1编码区序列长525 bp,编码174个氨基酸。功能生物信息学分析表明:MEA1含有1个完整的保守结构域,无跨膜螺旋结构,无N端信号肽序列,二级结构以无规卷曲为主,N末端疏水,C末端均亲水,有3类功能活性位点。系统进化分析表明:MEA1基因在进化中高度保守,且与人、长臂猿的亲缘关系最近,符合物种的系统分类地位。多组织相对荧光定量表达分析表明:MEA1基因在睾丸中高表达,在心、肝等其他14个组织中低表达。【结论】为探索BMI MEA1基因在睾丸形成和精子发生过程中的作用及功能奠定基础。
关键词： 雄性增强抗原 版纳微型猪近交系 组织表达 生物信息学
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滇龙胆环烯醚萜氧化酶基因及启动子的克隆与生物信息学分析
《中草药 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：目的从滇龙胆叶片中克隆单萜合成关键酶环烯醚萜氧化酶(GrIDO)基因及其启动子序列,并进行序列分析。方法根据滇龙胆转录组GrIDO基因序列设计基因特异性引物,使用RT-PCR方法克隆GrIDO基因的开放阅读框(open reading frame,ORF)序列,基于在线软件对GrIDO基因序列进行生物信息学分析。同时,根据GrIDO基因ORF序列,设计特异性引物,采用PCR法对该基因启动子序列进行扩增,并进行序列分析。结果 GrIDO基因(GenBank登录号KP722034)ORF全长1 557 bp,编码518个氨基酸;GrIDO蛋白相对分子质量58 920,理论等电点8.40,属于细胞色素P450超家族成员,可能定位于叶绿体;无信号肽,为亲水不稳定蛋白,主要由α-螺旋(51.07%)和环(42.69%)构成;GrIDO蛋白与长春花CrIDO蛋白具有较高的相似性(85.83%),且亲缘关系较近。GrIDO基因启动子(GenBank登录号KT428570)长720 bp,具有TATA-box和CAAT-box,还具有参与脱落酸和茉莉酸甲酯应答的顺式作用元件、光应答元件和MYB结合位点。结论GrIDO基因表达受多种因素调控。克隆了GrIDO基因ORF及其启动子,为GrIDO基因的功能验证奠定基础。
关键词： 滇龙胆 环烯醚萜氧化酶 基因和启动子克隆 生物信息学分析 开放阅读框
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仪器法测定滇黄精粗纤维素含量的研究
《时珍国医国药 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：目的通过改良纤维素测定方法,找到更加简便测定滇黄精纤维素含量的方法。方法对国标GB/T 5515-2008中纤维素测定仪法进行分步骤条件改良,根据相对标准偏差和测定结果得出针对性强、较简便的测定方法。结果相同管重复3次和不同管同时测定的相对标准偏差分别为0. 033和0. 038,表明该仪器具有良好的重现性;添加硅藻土有利于提高测定结果的稳定性;脱脂处理对结果无影响,脱脂处理可以忽略不计;碳酸盐去除过程对结果没有影响,可省去处理;加入消泡剂是必要的;氢氧化钠和氢氧化钾在碱消解过程中对测定结果没有差异,因此不做特殊要求。结论经过改良的粗纤维素含量测定方法针对性强,适用于滇黄精粗纤维素含量分析。不同地区滇黄精粗纤维素含量存在一定差异,为发掘优质食用滇黄精资源提供了基础数据。
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间作带型、宽窄行与密植对玉米和花生产量及相关性状的影响
《西南农业学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：【目的】探索适宜云南的玉米花生间作系统最佳种植模式。【方法】通过田间试验研究不同间作带型、种植密度及宽窄行种植方式对单/间作体系玉米花生产量及相关性状的影响。【结果】在相同种植密度条件下,相对于普通匀垄种植模式,宽窄行种植均能提高单作玉米及花生产量,且对玉米产量促进效果更显著;玉米花生在不同的间作带型及不同的种植密度下,多数处理表现出明显的间作优势,合理的间作带型及适宜的种植密度是保证该间作优势的关键因素,其中玉米花生采用2∶4间作带型,玉米种植密度与单作相同(7. 69万株/hm2),宽行行距0. 9 m,窄行行距0. 4 m,间作优势最大;间作系统中的优势作物产量对总产量影响较大,不同间作带型及种植密度均能影响单/间作系统中玉米花生产量,且种植密度对玉米产量影响更大,间作带型对花生产量影响更大,玉米产量随着种植密度的增加而增加,花生在2∶4间作带型产量较高。【结论】本研究筛选出玉米花生间作系统最适种植模式为玉米花生采用2∶4间作带型,玉米种植密度与单作相同(7. 69万株/hm2),宽行行距0. 9 m,窄行行距0. 4 m,花生密度比单作适当降低,可获得较高复合产量,间作优势最显著。
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